功能基因序列分析郭燕201483.ppt

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功能基因序列分析郭燕201483

二 已知功能基因的鉴定_以PQQ为例 PQQ是一种氧化还原酶的辅酶,广泛分布于植物、动物、微生物及周围环境中,具有多种生物学功能。 早在20世纪60年代,科学界开始对PQQ展开研究:先后在醋酸杆不动杆菌、荧光假单胞菌、欧文氏菌(Erwinia)等属中发现GDH含有一种相同的辅酶。它热稳定性好,能与亲核分子如氨基酸、巯基、氨等相互作用。 应用光谱、质谱等技术,研究发现苹果酸脱氢酶、乙醇脱氢酶也有这种辅酶,晶体结构分析表明,该辅基是一个含有三个羧酸基团的醌类,确定其结构式为 4,5-二氢-4,5-二氧-1氢-吡咯并(2,3-f)喹啉-2,7,9-三羧酸,命名为“吡咯喹啉醌 ”简称PQQ。 PQQ 只能在某些革兰氏阴性菌中合成,具有生物学功能如下: Ⅰ 刺激细胞生长 刺激微生物细胞生长:缩短菌体的迟缓期,类似菌体必需生长因子,随着浓度增长,加快菌体生长速度,提高菌体细胞产量;缩短菌体的迟缓期,不影响菌体细胞的生长速度。 刺激植物细胞生长:刺激花粉萌发,其模式与刺激微生物生长的模式大致相同,即通过缩短生长停滞期以达到刺激植物生长的目的。 PQQ能够促进烟草种子萌发,提高脂肪酶活性和种子呼吸速率, 还能够通过促进生长素和细胞分裂素合成,促进分子水平基因调控,从而提高植物细胞新陈代谢而发挥促进植物生长的作用。 在冬小麦花退化高峰的孕穗期和生长代谢旺盛期,喷洒PQQ 可以提高叶片中叶绿素含量,加快植物的光合作用,提高谷丙转氨酶和硝酸还原酶的活性,从而调节植株体内生理代谢功能,有益于改善植株营养供给,减少穗部小花败育,提高麦穗结实率。 2008 年,Choi 等报道了一种植物根际促生长细菌 ( plant growth promoting rhizobacteria,PGPR) Pseudomonas fluorescens B16,该菌株为合成 PQQ的野生型菌株,协和培养该菌与植物可以增加西红柿花数量、植株高度、果实数量和果实总重量,而所有不能合成 PQQ 的突变型菌株则没有此作用效果。因此,推测 PQQ 是 PGPR 发挥作用的重要原因之一。 刺激人体细胞生长:Naito 等报道低浓度 PQQ ( 0.003~30 μM)显著增强人成纤维细胞 DNA 的合成,并且显著增加细胞密度,相比之下,PQQ 的刺激作用优于成纤维细胞生长因子和胰岛素等生长因子,与上皮细胞生长因子的作用相当; 但当PQQ浓度达到750~1500 μM 时,DNA 合成受到抑制引起细胞死亡。国内(熊顺华等)也先后报道了适量浓度的 PQQ对大鼠皮质神经元和海马区神经元的生长速度有促进作用,但 PQQ 的浓度过高会产生毒性。 Ⅱ PQQ 是动物生长、发育和繁殖必需的营养因子 作为赖氨酰氧化酶的辅助因子:Kasahara 和 Kato 在前人研究基础上,通过比对酵母、果蝇以及小鼠参与赖氨酸代谢通路的同源蛋白,间接地证明了小鼠体内的赖胺酰氧化酶是以PQQ 作为辅助因子,建议将 PQQ 作为一种新的 B族维生素。 然而,Felton、Anthony 和 Rucker分别发表文章否定了 Kasahara 和 Kato 得出的实验结论。Rucker 等认为,从药理与营养学角度来分析,PQQ 定义为一种维生素的证据还不足,只能说它是一种重要的生物因子。因为不同物种对于维生素的需求存在较大差异,例如,维生素 C 是人类、灵长类生物必需的,但是鼠却不需要。因此,对人类来说 PQQ 是否是一种维生素,需要进一步研究证实。 Ⅲ PQQ 对自由基有清除作用,可以保护机体减少氧化损伤 在正常生理条件下,生物体保持一种自稳态,自由基的产生和清除维持动态平衡状态,自由基产生过少或过多都会对机体健康产生影响。PQQ 能够在没有谷胱甘肽 ( GSH)参与下直接清除过量的自由基。PQQ 清除自由基的效力是抗坏血酸的50~100 倍。如下3个方面: 保护心脏免受氧化损伤:PQQ 能够清除由缺氧再灌注产生的 ROS( reactive oxygen species), 显著降低心脏中乳酸脱氢酶的释放,在黄素还原酶催化作用下,催化产物还能够降低血红蛋白过氧化状态,消除缺氧再灌注对心肌的损伤。Tao 等报道,PQQ 能够抑制H2O2 诱导的大鼠心肌细胞 ROS 的产生、线粒体膜电位的降低,降低氧化应激、抑制线粒体功能的失活和保护大鼠心肌细胞等作用。 防止眼晶状体损伤及肝脏脂质过氧化:白内障的发生与自由基水平升高有关。PQQ能够提高晶状体中 GSH 水平防止氧化应激对晶状体的损伤,保证晶状体代谢的正常进行,从而避免了因晶状体蛋白变性而发生的混浊,缓解白内障症状。同样的原理,PQQ 可以通过提高肝脏中GSH 水平,从而抑制肝脏内脂质过氧化发生,促进胆绿素通

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