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单分子水平的酶催化与基因表达研究

物理化学学报(WuliHuaxueXuebao) 1976 ActaPhys.一Chim.Sin.,2010,26(7):1976-1987 July R【eview] www.whxb.pku.edu.cn 单分子水平的酶催化与基因表达研究 苏晓东1I2, 金坚石 ,s 谢晓亮 (北京大学生物动态光学成像中一C~,(BIOPIC),北京 100871; 北京大学生命科学学院,北京 100871 。北京大学前沿交叉学科研究院,北京 100871;4DepartmentofChemistryandChemicalBiology, HarvardUniversity,Cambridge,MA02138,USA) 摘要:近半个多世纪以来生命科学取得了非凡的进展,从DNA双螺旋结构的提出,到第一个酶晶体结构的被 解析,都得益于像x射线衍射 、核磁共振、质谱这样的物理化学1』l的发展.如今,在深入细致地定量研究生物 活体系统中我们正面临新的挑战,例如:了解酶及其他大分子复合物在体内是如何实时工作的,它们在分子数很 少时是怎样工作的,在活细胞中大分子复合物是如何协调工作的,以及不同的基因在活细胞中分子数很少的情 况下是如何实现表达和不表达的等等.近十多年来,单分子成像,超高分辨率显微镜和单分子操纵技术在世界范 围内被广泛地运用于生物医学研究,对生物化学和分子生物学的发展产生着深远的影响,因为运用这些单分子、 超高分辨技术,使很多如上述的令人感兴趣的生物学问题实现了单分子层面上的研究和理解.本文拟就近年来 相关的物理化学方法特别是单分子方法和技术在生物医学中的应用做一个简要介绍. 关键词: 单分子酶学;米氏方程;荧光蛋白;乳糖操纵子;基因表达;阻遏子 中图分类号: 0643 EnzymeCatalysisandGeneExpressionStudiesatSingleM oleculeLevel SU Xiao—Dong,。 JINJian—Shi。 XIESunneyXiaoliangA (BiodynamicsOpticalImagingCenter(BIOP1C),PekingUniversity,Beijing 100871;2SchoolofLireSciences, PekingUniversiyt,BeUing 100871;3AcademyforAdvancedInterdisciplinaryStudies,PekingUniversiyt,Beijing 100871 4DepartmentofChemistryandChemicalBiology,HarvardUniversiyt,Cambridge,MA02138,USA) Abstract: Overthelasthalfcentury,theoverwhelmingadvancesinbiologicalscienceshavebeengreatlyaidedby thephysicalandtechnologicalinnovations,suchasX—raydiffractionmehtods,nucleramagneticresonance(NMR)nad massspectroscopy,etc.Inrecentyeras,single—moleculeexperimentshavechangedhtewaymanybiologicalproblems raeaddressed.Knowledgefromhteseexperimentscontinuestoemerge.Wearenowabletofollowbiochemicalreactions ofasingleenzymemo

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