uniprot 蛋白库下载和添加到PD流程.docx

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2017-06-03 发布于湖北
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uniprot 蛋白库下载和添加到PD流程.docx

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Uniprot网址/1、打开网址2、如果选择单个蛋白的数据库，则选择UniProtKB3、输入蛋白名称，如breast milk，回车搜索。结果显示有10， 395个蛋白。4、点击download，在对话框中选择download all，FASTA文件可以选择正式蛋白，或者正式加同分异构体；选择不压缩文件。点击GO，save。5、如果选择下载蛋白质组，则选择Proteomes，在随后的搜索框中输入比如“Homo Spiens”（human智人的学名），其他同上方法下载。注意：下载过程中可能会下载不完全而显示下载完成的情况，这可能是由于网速不好造成的，可以多下载几次，比对数据库大小的差异，选择较为完整的数据库。二、1、打开PD软件，在任务栏点击Administration下拉的Maintain FASTA Files2、在打开的窗口任务栏点击Add，找到所下载的数据库文件即可。3、等待状态显示为“Completed”即为添加完成。4、打开原有Workflow平台，在Sequest HT下更改Protein Database文件即可。5、在菜单栏中Workflow下选择Save As Template一个新名称即可