ChemAxon软件包在计算机辅助药物设计课程中的应用.pdf

药学教育2016年 第32卷 第6期 ChemAxon软件包在计算机辅助药物设计课程中的应用 王 巍 武汉大学药学院 (武汉 430071) 摘 要 ChemAxon是一种基于Java的跨平台药物信息学综合软件包，是全球领先的专业性化学软件。主要介绍 ChemAxon包中的常用的功能及应用，通过实际案例的使用与分析，探索其在药学专业中通过对其功能的使用和实 践。在课程 中，该软件可以加深学生对于计算机辅助药物设计中小分子信息处理的理解与使用，从而提高学生的 综合 能力。 关键词 ChemAxon化学软件；计算机辅助药物设计；化学信息学 Application ofChemAxonSoftwarePackageinComputerAi dedDrug ． DesignCourse WANG Wei (SchoolofPharmaceuticalSciences，WuhanUniversity，Wuhan430071，China) Abstract：ChemAxon istheworldleadingCheminformaticpackageand issued inmultipleOSplatform basedonJava．Themainfunctionsandapplicationsareintroducedandillustratedbytheseveralcases presentationand analysis．Thestudentscouldunderstand and makeuseofthe basic cheminformatic conceptsintheCADD classbytheChemAxonoperation，thentheycouldachievebetterintheirfuture careers ． Keywords：ChemAxonchemistrysoftware；ComputerAidedDrugDesign；Cheminformatics 计算机辅助药物设计课程中对于小分子库的处 以帮助科学家通过强大的化学信息工具和程序来管 理中经常涉及化学信息学的内容和相关软件的操作 理化学数据。ChemAxon软件套装主要有结构可视 和使用[1-2]。ChemAxon软件在化学信息处理中具 化、属性预测、虚拟合成、工作流和分析、筛选和药物 有重要的应用价值，在全球工业界和学术界得到了 设计等几类，可处理科研中大量复杂的化合物结构 广泛应用 ]，但无论从期刊或者中文搜索引擎中可 和反应，有些模块的功能在国外的专业期刊有专门 以发现该软件在国内使用介绍等方面都很少见。本 报道。例如，Screen3D可以根据结构相似度对大型 文 目的在于通过对ChemAxon软件包内常用软件功 的化合物库进行筛选_5J，在早期药物发现中有重要 能和使用的介绍让大家能够了解和认识该软件的强 的作用；Metabolizer可以预测化合物的代谢情况，如 大功能，认识到其在教学科研中的重要作用，并在教 代谢稳定性和代谢物；MarvinSpace可以进行3D分子 学中培养学生使用该软件的习惯，为化学信息学以 结构的可视化，测量分子