辣椒抗病基因同源序列的克隆和分析.PDF

中国农业科学 2008,41(1):169-175 Scientia Agricultura Sinica 辣椒抗病基因同源序列的克隆与分析 1 1 2 2 1 2 1 张丽英 ，陈儒钢 ，张俊红 ，欧阳波 ，肖景华 ，李汉霞 ，叶志彪 1 2 （华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室，武汉 430070 ； 国家蔬菜改良中心华中分中心，武汉 430070 ） 摘要： 【目的】利用同源序列法分离辣椒抗病基因同源序列。【方法】根据已知植物抗病基因的NBS-LRR 保 守结构域设计简并引物，以辣椒品系PR205基因组DNA为模板对抗病基因同源序列进行扩增。【结果】获得了25 个抗病基因同源序列（resistance gene analogs，RGAs），聚类分析将其分为7个不同的类别。由其核酸序列推 导的氨基酸序列与 Mi-1.2、prf、Hero、I2C-1、RPM1 基因相应区域的同源性为 27.4%～98.2%。其中 RGA-p20 与 Mi-1.2 基因的核苷酸和氨基酸序列相似性均达到99%，确认RGA-p20为抗根结线虫基因的一部分，即辣椒中也含 有与 Mi 基因同源的根结线虫抗性基因。【结论】本研究在辣椒品系PR205中获得了抗病基因同源序列，为辣椒抗 病基因的克隆奠定了基础。 关键词：辣椒；抗病基因同源序列；抗病基因；NBS-LRR Cloning and Analysis of Resistance Gene Analogs from Pepper (Capsicum annuum L.) 1 1 2 2 1 2 1 ZHANG Li-ying , CHEN Ru-gang , ZHANG Jun-hong , OUYANG Bo , XIAO Jing-hua , LI Han-xia , YE Zhi-biao 1 ( National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070; 2 National Center on Vegetable Improvement (Central China), Wuhan 430070) Abstract ：【Objective 】 Isolating resistance gene analogs from pepper using homology-based method. 【Method 】The resistance gene analogs from pepper (Capsicum annuum L.) line PR205 were amplified using degenerated primers based on the conserved regions of Nucleotide Binding Site (NBS)-Leucine Rich Repeat (LRR) domain from plant resistance genes reported. 【Result 】 Twenty-five resistance gene analogs (RGAs) were obtained. These RGAs were classified into seven distinct groups by phylogenet