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ベイズ統計の基礎
ベイズ統計の基礎
水産資源学におけるベイズ統計の
応用ワークショップ
2007年8月2-3 日,中央水研
遠洋水産研究所 外洋資源部
鯨類管理研究室
岡村 寛
なぜベイズ法を使うのか?
• 水産資源学・生態学では,必ずしも実験デザインを
きちんとコントロールした上でデータが得られるわけ
ではない
• その場合,データとその扱いに様々な問題が起こる
データ間の相関,個体差によるばらつき,
コントロールされない自然変動,
小さな標本サイズ,多くの欠測値,
直接的なデータはないが間接的な情報ならある,
複数のデータセットの統合,複雑な意思決定
なぜベイズ法を使うのか?
• そのような場合,パラメータの数は多くなり,
モデルは複雑な階層構造を持つものになり
がち.
• そんなときベイズ法は大変ありがたく,強力な
武器となる.
• ベイズ法のひとつのネックは計算が大変であ
るということだったが,理論と道具の発展によ
り,敷居がどんどん低くなってきている.
このトークの内容
• ベイズ法の基本的考え方
• 従来の統計学とベイズ統計学
• 水産資源管理に対するベイズ法
の応用例
• 階層ベイズモデル,モデル選択
ベイズ法の基本的考え方
釣り人の漁場選択
漁場A :0.8 漁場B: 0.2
魚が釣れる確率0.1 魚が釣れる確率0.6
魚が釣れない確率0.9 魚が釣れない確率0.4
確率記号で
• 漁場Aを選んだとき釣れる確率(条件付確率)
P(釣れる|A) = 0.1
• 漁場Bを選んだとき釣れる確率(条件付確率)
P(釣れる|B) = 0.6
• ある人が漁場Aを選んで,魚が釣れる確率
P(A, 釣れる) = P(A) ×P(釣れる|A)
= 0.8 ×0.1 = 0.08
P(釣れる|A) = P(A, 釣れる)/P(A)
条件付確率
• Xが起こったという条件のもとで,Yが起
こる確率
P(Y|X) = P(X, Y)/P(X)
• Yが起こったという条件のもとで,Xが起
こる確率
P(X|Y) = P(X, Y)/P(Y)
• P(X, Y) = P(X|Y)P(Y) = P(Y|X)P(X)
結果から原因を推測する
P(X, Y) = P(X|Y)P(Y) = P(Y|X)P(X)
X :原因,Y :結果とせよ.
P(X|Y) = P(原因|結果)
= P(Y|X)P(X)/P(Y) = P(結果|原因)P(原因)/P(結果)
結果(データ)から原因(パラメータ,仮説)の推測へ
サンプル 自然現象
ベイズの公式
P(X|Y) = P(Y|X)P(X)/P(Y)
• P(X|Y) :データYが与えられた時のパラメータXの確
率分布(事後分布)
• P(Y|X) :パラメータXが与えられた時のデータYが得
られる確率(尤度)
• P(X) :パラメータXのデータを得る前の確率分布(事
前分布)
• P(Y) :可能なすべてのパラメータの値のもとでデー
タYが得られる確率分布 P(Y) = ΣX P(Y|X)P(X)
ベイズの公式
P(X|Y) = P(X,Y)/Σ P(X,Y)
X
= P(Y|X)P(X)/ΣX P(Y|X)P(X)
= P(Y|X)P(X)
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