黄瓜23对高多态性SSR标记的筛选与评价.pdfVIP

园 艺 学 报 2011 ，38 （11）：2140 –2148 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 黄瓜 23 对高多态性 SSR 标记的筛选与评价 * * ** 吕 婧 ，时秋香，任 毅，张忠华，黄三文 （中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京 100081 ） 摘 要： 目前在黄瓜种质研究中仍然缺乏可用的引物。利用黄瓜基因组连锁遗传图谱开发的 995 对 备选 SSR 引物，挑出在 7 条染色体上均匀分布且能扩增出清晰稳定单一条带的多态性引物 23 对，并利用 这些引物对黄瓜种质遗传多样性进行了探讨。通过来自不同国家和地区的 30 份代表性黄瓜种质资源进行 SSR 扩增分析，从中能够得到 153 条多态性条带。不同引物分析得到的种质遗传多样性差异较大，供试 种质间平均期望杂合度为 0.57，平均 PIC 值（多态性信息量）为 0.60 。23 对引物可以清晰检测出亚洲、 欧美和印度群体遗传多样性，较客观地反映了群体结构和地域性差异等信息。 关键词：黄瓜；基因组连锁遗传图谱；SSR 标记；种质遗传多样性 中图分类号：S 642.2 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2011 ）11-2140-09 Screening and Evaluation of 23 High Polymorphism SSR Markers in Cucumber * * ** Lü Jing ，SHI Qiu-xiang ，REN Yi ，ZHANG Zhong-hua ，and HUANG San-wen （Institute of Vegetables and Flowers ，Chinese Academy of Agricultural Sciences ，Beijing 100081，China ） Abstract ：At present ，useful primers in the study of cucumber germplasm are scarce ，in this study， 23 SSR primers are selected from the 995 primers of cucumber genome linkage map ，the 23 SSR primers distribute on the linkage map uniformly and can amplify clear，stable and single bands，using these markers ，the genetic diversity of 30 cucumber （Cucumis sativus L. ）accessions from different countries or regions was detected ，and 153 polymorphism bands were got. Genetic diversity differs among 23 primers. The expected heterozygosity of detected resources is 0.57 ，and the average of PIC （Polymorphism information content ）value is 0.60. The results distinctly prove the genetic diversity among Asian ， European and India res