第三章2b生物信息的传递从dna到rna.ppt

 RNA链的延伸图解 RNA合成过程 1.原核生物的RNA聚合酶 全酶 (Holo Enzyme)和核心酶(Core Enzyme) (1) 全酶（Holo Enzyme） 用于转录的 依靠空间结构与DNA模板结合 (σ与核心酶结合后引起的构象变化) 模板的识别阶段包括RNA聚合酶全酶对启动子的识别，聚合酶与启动子可逆性结合形成封闭复合物。 专一性地与DNA序列(启动子)结合 半衰期：数小时 转录效率低，速度缓慢（ σ的结合 ） E. coli RNA polymerase （1）核心酶（Core Enzyme） 作用于转录的延伸过程（终止） 依靠静电引力与DNA模板结合（蛋白质中碱性基团与DNA的磷酸根之 间） 非专一性的结合（与DNA的序列无关） 半衰期：60秒 E.Coli RNApol 的亚基组成 core enzyme （3）全酶的组装过程 此外，新发现的一种ω亚基的功能尚不清楚。 （2） σ 因子 ? σ因子可重复使用 ? 修饰RNApol构型 ? 使Holo Enzyme 识别启动子的Sextama Box(－35区),并通过σ与模板链结合 E.coli中不同的?因子可识别不同的启动子 （2）α因子 核心酶的组建因子 促使RNApol 与DNA模板链结合 前端α因子－－使模板DNA双链解链为单链 尾端α因子－－使解链的单链DNA重新聚合为双链 （3）β因子 完成NMP之间的磷酸酯键的连接; Editing 功能 (排斥与模板链不互补的碱基); 与Rho （ρ）因子竞争RNA 3’－end; 构成Holoenzyme 后,β因子含有两个位点; I site (initiation site . Rifs): 该位点专一性地结合; ATP或者GTP (需要高浓度的ATP或GTP); E site(elongation site RifR): 对NTP非专一性地结合（催化作用和Editing功能）. ?参与RNA非模板链（sense strand）的结合 （充当SSB） 有义DNA链结合位点（ β’亚基提供） DNA/RNA杂交链结合位点（β亚基提供） 双链DNA解链位点（前端 α亚基提供） 单链DNA重旋位点（后端α亚基提供） σ因子作用位点 原核生物RNApol (Core) 的结构与功能 RNA pol 执行多种功能 (1) 识别DNA双链上的启动子； (2) 使DNA变性在启动子处解旋成单链； (3) 通过阅读启动子序列，RNA pol确定它自己的转录方向和模板链； (4)最后当它达到终止子时，通过识别停止转录。 RNA链的延伸是在δ因子释放之后，在RNA聚合酶四聚体核心酶的催化下进行。因RNA聚合酶同时具有解开DNA双链，并使其重新闭合的功能。随着RNA的延伸，RNA聚合酶使DNA双链不断解开和重新闭合。 2. 真核生物的RNA聚合酶 真核生物中已发现有三种RNA聚合酶，分别称RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ。 RNA聚合酶Ⅱ转录生成hnRNA和mRNA，是真核生物中最活跃的RNA聚合酶。 RNA聚合酶Ⅲ转录的产物都是小分子量的RNA，tRNA的，5SrRNA的和snRNA。 RNA聚合酶Ⅰ转录产物是45SrRNA，生成除5SrRNA外的各种rRNA。 E.Coli各σ识别的启动子的序列 原核生物的转录与翻译同时进行 实际上在原核生物中，RNA的转录、蛋白质的合成以及mRNA的降解通常是同时进行的。因为在原核生物中不存在核膜包裹的细胞核。另外，RNA的转录和多肽链的合成都是从5’向3’方向进行，只要mRNA的5’端合成后，即可以开始蛋白质的翻译过程。在原核生物中mRNA的寿命一般只有几分钟。因此，往往在3’端mRNA的转录还没有最后结束，5’端mRNA在完成多肽链的合成后，已经开始降解。 原核生物转录的过程 原核生物转录的过程 1.聚合酶全酶上的p因子能识别启动子，并识别有义链，从而使全酶定位到启动子部位。 2. 由全酶在启动子附近将DNA局部解链，约解开17个碱基对。（酶与启动子结合的部位是AT富集区，有利于解链）? 3.第一个核苷三磷酸(常常是GTP或ATP)结合到全酶上，形成“启动子-全酶-核苷三磷酸”三元起始复合物。 原核生物转录的过程 4. 第二个核苷酸参入，连结到第一个核苷酸的3‘羟基上，形成了第一个磷酸二酯键。 5. p因子从全酶上掉下，又去结合其它的核心酶 6. 当s因子从核心酶上脱落后，核心酶与DNA链的结合变得疏松(依靠其蛋白质的碱性与酸性核酸之间的非特异性的静电引力)，可以在模板链上滑动，方向为DNA模板链的 3′→ 5′，同时将核苷酸逐个加到RNA链的3‘-OH端，使RNA链以 5′→ 3′方向延伸。 7. DN