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保育遗传学导论读书笔记 第一章 绪论 1、IUCN（国际自然保护联盟）认为保护生物多样性必须包括遗传多样性、物种多样性和生态多样性三个层面。 2、IUCN(1997)认为有12.5％的维管植物收到灭绝的威胁，其中裸子植物大大高于被子植物，分别为32％和9％。 3、从1600年有记录以来，有超过800个物种已经灭绝，其中大部分是岛屿物种。例如， 81％被记录的灭绝鸟类是岛屿生栖型的，虽然大约只有20％的鸟类生活在岛屿上（Myers 1979）。 4、濒危的定义（IUCN 1996）: 灭绝可能性：极危 （50％）、濒危（20％）、渐危（10％）。 5、物种灭绝的主要因素是栖息地的丧失、外来物种入侵、过度开发利用和环境污染。这些因素实际上都是由于人类活动和人口增长造成的。 6、随机的、群口的、环境的、灾难的和遗传的因素都会增加小居群灭绝的风险。 7、小居群会发生近交和遗传多样性丧失，进而增加灭绝的风险，因此遗传管理的一个主要的目标就是如何减小居群中的近交和遗传多样性丧失。 8、通过避免近交和遗传多样性丧失来降低灭绝的风险，例如，濒危物种美洲豹就是由于遗传多样性丧失和近交导致的缺陷，而引起了精子的数量和质量差及形态上的不正常等一系列遗传上的问题，为了减轻这些遗传上的不量影响，人们把最近缘的亚种——德克萨斯豹引入到美洲豹的居群。 9、澳大利亚的一种孑遗植物梧莱米松在几百个基因位点上没有遗传多样性，有极大的灭绝风险，且易感染枯梢性真菌病害，检测无抵抗力（Woodford 2000）。 10、对于红冠啄木鸟野生居群片断化并有显著遗传分化的情况，对其小居群移入外来近缘个体可以减少近交风险和遗传多样性丧失。 11、遗传标记有助于疑难分类群的界定。如遗传分析表明没过乔治亚洲濒危的口袋地鼠和该地区的普通口袋地鼠没有区别，因此这种口袋鼠不是濒危的，没有必要保护这种迁徙的乔治亚口袋地鼠群体。 12、种内管理单元的确定可以保护不同环境条件适应下表现出明显遗传分化的特殊单元，如银鲑。 13、种间杂交可能导致遗传多样性丧失，如极危的埃塞俄比亚狼可能是被当地的家养狗杂交掉。 14、利用DNA分析可以找到濒危物种的回归引种地点，如北方毛鼻袋熊不只在澳大利亚昆士兰有分布，在新南威尔也曾经有分布。 15、选择最适的“源居群”进行回归引种。 第二章 遗传学理论与灭绝 1、近交降低物种的繁殖和生存能力，即通常称为近交衰退。 2、1962年美国利诺伊州的草原榛鸡居群由于近交衰退导致繁殖力和孵化率降低，引入没有亲缘关系的个体后恢复了繁殖力和孵化率，居群数量随之增大。 近交系数F：对个体来说，近交系数是指它的亲本之间的亲缘关系有多近。当它的亲本无近缘关系时，后代的F=0，然而，当它们是完全近交时，F=1。 遗传多样性：是指一个居群、一个种或几个种的集群中的可遗传变异的多少，如杂合度、等位基因的数量或遗传力。 群口随机性：出生率、死亡率以及性别比率的波动。 认为控制的实验近交居群及家养动植物近交居群的研究表明，近交增加灭绝速率（老鼠和果蝇通过兄妹近交交配（Bowman Falconer 1960; Kosuda 1972;Rumball 1994）。 居口随机波动的影响很小，活在灭绝中根本不起作用（Frankhan 1995b）。 居群中死亡比例随着近交水平的升高而增加，但死亡不会再近交发生时就开始，只有近交达到中等或临界水平时才会开始。 哺乳动物、鸟类、无脊椎动物和植物对近交衰退的敏感度差异很小。 灭绝漩涡：居群大小降低和遗传多样性丧失与近交之间的反馈作用。 小居群比大居群有更高的灭绝速率。北美加拿大盘羊生存时间和居群大小之间的关系（Berger 1990）。 在世界范围内，人类正使生物的栖息地片断化，而导致“岛屿”居群的产生。 在自交不亲和植物的小居群中，自交不亲和位点遗传多样性丧失导致植物生殖健康度下降。 两个小的近交居群，由相应的等位基因组成的纯合子各自只能抗一种疾病。相反，同时拥有这两个等位基因的大居群却能同时抵抗两种疾病。 遗传多样性 复合分析得到数据表明，居群平均杂合度与居群健康度之间存在显著相关性（Reed and Frankham 2001）。 遗传多样性通常用多态性（P）、平均杂合度(H)、等位基因(A)多样性来描述。 多态位点常被定义为最高频率等位基因的频率应小于0.99或0.95 多态位点比率（P）：多态位点与所有取样位点的比例。如，如果3个位点多态，7个位点单态，则P=3/7=0.3 平均杂合度（H）：所有位点杂合体比例的和与取样总位点数的比例。如，一个居群的5个位点的杂合体的比例分别为0、0.10、0.20、0.50、0，那么H=（0+0.10+0.20+0.50+0）/5=0.07 等位基因多样性（A）：平均每个位点的等位基因数目。如