五指山猪小群体遗传学检测.pdfVIP

第28卷第6期 2007年 11月 家畜生态学报 Vo1．28 No．6 Acta Eeologiae Animalis Domastiei Nov．2007 五指山猪小群体遗传学检测 侯冠或，王东劲，管 松，荣 光，黄显洲 (中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，海南儋州 571737) [摘 要] 本研究利用26个微卫星基因座对中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 保种场的五指山猪小群体58个样本进行了遗传学检测，用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电 泳检测微卫星的PCR扩增产物，统计了群体平均基因纯合率、等位基因数，利用等位基因频率 计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)。统计结果：全群平均基因纯合率 为66．5 ；平均多态信息含量、平均观测杂合度为、平均期望杂合度分别为0．807、0．338、 0．835；每个位点平均等位基因数为11．92，此结果说明该群体虽然近交程度较高，但仍具有丰 富的遗传多样性，遗传变异较大。 [关键词] 微卫星；五指山猪 ；基因纯合度；杂合度；PIC [中国分类号] S811．5 [文献标识码] A [文章编号] 1004—5228(2007)06—0044—05 五指山猪(Wuzhishan pig)原产于海南省五指 于品种遗传多样性分析[卜引。本研究利用分布于 山地区，是当地少数民族饲养的一种小型猪，其个体 16条染色体上的26对微卫星基因座对中国热带农 小、灵活、头尖长，体型似鼠，俗称“老鼠猪’，[¨。该猪 业科学院热带作物品种资源研究所五指山猪保种场 具有抗逆性强、性成熟早、瘦肉率高、肉质细嫩、皮薄 的小群体进行遗传学检测，旨在为五指山猪品种资 骨细、遗传稳定、代谢率低、适应性强等诸多特性[2]。 源的保存及进一步的遗传育种工作提供参考依据。 其解剖学、生理学特征及疾病发生机理等都与人类 1 材料和方法 极相似，具有重要的经济和社会价值，可用于心血管 病、皮肤烧伤和新药评价等许多方面研究[3]，是我国 1．1 材料 十分宝贵的小型猪品种资源之一，但由于外来猪种 1．1．1 样本 随机采取中国热带农业科学院热带 冲击及饲养方式不当等原因导致某些优良特性逐渐 作物品种资源研究所五指山猪保种场58个个体耳 消失，因此，加强五指山猪遗传资源的保护与科学利 组织，用75 乙醇浸泡并冻存于一7O℃冰箱中备 用显得十分重要。 用。 微卫星DNA(Microsatellite DNA)，又称简单 1．1．2 引物 选取26对来自猪不同染色体的微卫 序列重复(simple sequence repeat，SSR)，是一种由 星引物序列，引物序列见表 1。引物由上海生物工 2～6个核苷酸为重复单位串联组成的长达几十个 程有限公司合成。 核苷酸的序列。它广泛分布于整个真核生物基因组 1．1．3 试剂 1O×PCR Buffer；dNTP；Taq DNA 的不同座位上，由于在各个座位上重复单位的数量 聚合酶由大连宝生物工程有限公司提供。 可能不完全相同，因而形成多态性。相对于其它遗 1．2 方法 传标记，其多态信息含量高，数量多，分布均匀，呈共 1．2．1 基因组DNA提取 取约20mg耳组织，剪 显性遗传， 碎，放入 1．5mL的Eppendorf离心管内，用蛋白酶 以及分析方便、快捷，而被国内外学者广泛应用