水稻粒形基因GW8的功能标记开发和单体型鉴定.pdfVIP

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2016，42(9)：1291-1297 http：／／zwxb．chinacrops．org／ ISSN 0496—3490；CODEN TSHPA9 E—mail：xbzw@chinajourna1．net．cn DoI：l0．3724／SP．J．1006．2016．01291 水稻粒形基因GW8的功能标记开发和单体型鉴定 裔传灯 王德荣 蒋 伟 李 玮 成晓俊 王 颖 周 勇 梁国华 顾铭洪 扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点 ／粮食作物现代产业技术协同创新中心 ／教育部植物功能基因组学重点实验 室，江苏扬州 225009 摘 要：水稻粒形性状包含粒长 、粒宽、粒厚和长宽比，是一类影响水稻产量和品质的重要性状 。基于基 因GW8序 列分析，在该基因启动子区 10bp的Indel和第 3外显子A／C和T／G的2个变异位点分别开发了功能标记，并将其用 于294份水稻微核心种质和江苏省审定的65份粳稻品种的基因型鉴定。研究结果表明这 3个变异位 点的等位变异对主要的粒形性状有着显著或极显著的影响；其在水稻微核心种质存在的 8种单体型对水稻粒形性状 有着极显著的影响，其中分别有 126、85和 58个代表品种的Hap3、Hap6和 Hap1是最主要的单体型，单体型Hap7 对应水稻籽粒的粒长最长 、长宽比最大、干粒重最大；而江苏省审定的粳稻品种中仅发现分别有 63个和 2个代表品 种的单体型是 Hap6和Hap2。这些研究结果为水稻产量和品质育种中充分利用基因GW8的优异等位基因或单体型奠 定了基础。 关键词：水稻：粒形：基因GW8；功能标记；单体型 DevelopmentofFunctionalM arkersand Identification ofHaplotypesforRice GrainShapeGeneGW8 YIChuan—Deng ，WANG De．Rong，JIANGW ei，LiWei，CHENG Xiao．Jun，WANGYing，ZHOU Yong，LIANG Guo—Hua，andGU M ing—Hong JiangsuKeyLaboratoryofCropGeneticsandPhysiology，Co—InnovationCenterforModem ProductionTechnologyofGrainCrops，KeyLabora— tory ofPlantFunctionalGenomicsoftheMinistryofEducation，YangzhouUniversity,Yangzhou225009，China Abstract：Ricegrainshapeincludinggrainlength，grainwidth，rgainthickness，andrgainlength—to—widthratioisamajorcharac- teraffectingriceyieldandquality．OnthebasisofthealignmentofgeneGW8genomicDNA sequence，threefunctiona1markers weredevelopedonthe10_bpindelinpromoterregionandtwomissensepolymorphism sites(A／CnadT／G)intheexon3，respec． tively．SubsequentlythemarkerswereusedtoidentifythegenotypesofgeneGW8inthe294accessionsofricemini--corecollec-· tionand65japonicavarietiescertificatedinJiangsuprovincefrom2007to2013．Wefoundthattheallelicvariationsofthethree targetlocihadsignificantorverysignificanteffectsonmosttraitsofrgainshape．Onthebaisofthethreevariationsitesofgene GW8，eighthaplotypes(combinations)werefoundtohaveverysignificanteffectoi