第五章三个牦牛品种（类群）线粒体dna d-loop区的遗传多样性及其 .docVIP

硕 士 学 位 论 文 题 目 昌台牦牛遗传多样性蛋白和基因水平的研究 作 者 高杰 完成日期 2014 年 4 月 8 日 学 科 门 类 农 学 专 业 基础兽医学 研 究 方 向 动物生化与分子遗传学 指 导 教 师 郑玉才 教授 学院（系、部） 生命科学与技术学院 授予学位日期 年 月 日 Genetic diversity of Changtai yak at protein and gene levels By Jie Gao A Thesis Submitted To Southwest University for Nationalities In Fulfillment of the Requirements for Master Degree Supervisor：Yucai Zheng (Professor) College of Life Science and Technology Southwest University for Nationalities Chengdu, 610041, P.R. China May 2014摘 要κ-酪蛋白（κ-CN）基因重复片段多态性，对分布于四川省的昌台牦牛、麦洼牦牛和九龙牦牛的遗传多样性进行全面的分析和比较。主要研究成果如下： 1、微卫星、小卫星和mtDNA D-loop分析显示，三个牦牛品种（类群）具有丰富的遗传多样性。昌台牦牛的基因杂合度（Ho）或单倍型多样度（Hd）均高于麦洼牦牛和九龙牦牛。 2、mtDNA D-loop分析显示，三个牦牛品种（类群）具有相近的遗传距离，提示它们在母系起源上亲缘关系较近；微卫星和MUC1多态性分析均显示，昌台牦牛与麦洼牦牛之间有更近的遗传距离。结合三个牦牛品种（类群）LDH1和κ-CN的多态性特征，我们认为昌台牦牛与麦洼牦牛的亲缘关系比其与九龙牦牛之间的亲缘关系更近。 3、本研究首次从分子水平上对昌台牦牛的遗传多样性进行了全面分析，通过与麦洼牦牛、九龙牦牛两个牦牛品种的聚类分析，初步提示昌台牦牛是一个独立的牦牛类群。 4、本研究还建立了一种简便的PCR和电泳方法，用于检测牦牛κ-CN基因第四外显子12-bp重复片段的遗传多态性。 关键词：昌台牦牛；遗传多样性；亲缘关系；mtDNA D-loop；MUC1；微卫星；κ-酪蛋白基因；乳酸脱氢酶-B（Ldhb）基因 Abstract The main objective of this study was to investigate the genetic diversity of Changtai yak population in Sichuan province at molecular level, and to identify their genetic relationships with Maiwa yak breed and Jiulong yak breed, in order to provide scientific data for the utilization of Changtai yak genetic resources. Comprehensive analysis and comparison of the genetic diversity of Changtai yak, Maiwa yak and Jiulong yak in Sichuan province were carried out using 15 microsatellite loci, mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop sequence, an expressed sequence of mini-satellite (the epithelial mucin of milk, MUC1), and the unique polymorphisms of the lactate dehydrogenase-1 (LDH-1) and the duplication fragmet of κ-casein (κ-CN) in yak. The main results are as follows: 1. The analysis using microsatellite, mini-satellite and mtDNA D-loop showed the three yak bre