定量差异蛋白质组学数据分析处理方法 - abc.PDF

2012春ABC课程期末汇报15组 定量差异蛋白质组学数据分析处理方法 Data analysis of quantitative differential proteomics 组员：王舒心 白雪李泽洋鲍锦涛 汇报人：鲍锦涛 时间：2012. 06. 11 主要内容 •  蛋白质组学简介 •  定量差异蛋白质组学工作流程 •  定量差异蛋白质组学数据分析 蛋白质组学简介 组学（Omics） 组学指的是一类个体的集合。 包括：基因组学（Genomics），转录组学(transcriptomics） 蛋白组学（Proteomics），代谢组学（Metabolomics），转 录组学脂类组学（lipidomics）， 免疫组学（Immunomics）， 糖组学（glycomics ）和 RNA组学(RNomics)等。 蛋白质组学简介 蛋白质组与蛋白质组学 •  蛋白质组指的是一个细胞，一个组织或一种生物的基因组所表达 的全部蛋白质总和。 •  蛋白质组的研究特点： 全面性 + 动态性 + 整体性 •  蛋白质组学的研究领域： 表达蛋白质组学 定量蛋白质组学 蛋白质翻译后修饰 功能蛋白质组学 表达蛋白质组学 。。。。。。 蛋白质组学简介 常用的定量蛋白组学技术 SILAC技术 荧光差异电泳技术 SRM技术 iTRAQ标记技术 Label-free 技术 工作流程 SILAC定量蛋白质组学工作流程 “Light” “Heavy” 定量精确 高效性 高灵敏度 高通量 /pierce 数据分析 Ø  原始数据初筛 u 筛选出关键数据，清除Contaminant等分析障碍 数据分析 Ø  原始数据初筛 u  保留关键条目，如Uniprot AC 等 u  找出两次重复都出现的蛋白（利用Exel VLOOKUP IF函数） u  根据两次重复的平均Ratio值排序删去(0.5,2) OR (0.67,1.5) 对应结果 数据分析 Ø  散点图重复性分析 数据分析 Ø  散点图重复性分析 1. 2. u  取Ratio值的对数进行相关性分析 数据分析 Ø  散点图重