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专题单基因遗传病发病风险的估计
遗传教研室 单基因遗传病发病风险的估计bayes公式的应用 唐吟宇 一、概念 前概率:根据亲代的情况计算出来的概率 条件概率:根据自己或子代情况计算出来的概率 联合概率:前概率与条件概率的乘积 后概率:联合概率的相对频率 二、举例说明 Ex1:慢性进行性舞蹈病(AD) 已知(条件):30岁以前发病的占1/3。一位女性,父亲是患者,本人已到30岁尚未发病。 问:该女性发病的风险还有多大? 解:30岁以前发病的占1/3可以从4个方面来理解 根据题目所给条件即:30岁尚未发病,与2)相符,所以2)即是本题的条件概率。 Bayes方法首先要作“假设”,其依据是要回答的问题只有在哪种“情况”下才会发生,就假设这种“情况”,另一个是相反的假设,该女性表型正常,基因型为aa或Aa. 所以Aa的概率为0.40,即发病的风险为40% 原来的方法 50% Bayes方法 40%(降低) Ex2.Hurler综合症(AR) 已知(条件): Ⅳ1正常(若Ⅳ1是患儿,不必再算) 问: Ⅳ2发病的风险( Ⅳ3 Ⅳ4…… ) 解: Ⅲ1与Ⅲ2表型正常,基因型组合三种可能性 Ⅳ2是患儿的风险:3/143*1/4=3/572 原来的方法 1/6*1/6*1/4=1/144(0.69%) Bayes方法 3/572=0.52%(降低) Ex3.自毁容貌综合症(XR) 已知(条件):Ⅲ24个弟弟均正常 问:Ⅳ1发病的风险 关键是求Ⅲ2是XAXa的概率,这取决于Ⅱ4 是XAXa的概率。且若对Ⅲ2作假设,则其4个弟弟均正常的条件就无法用。因此只能对Ⅱ4作假设(才能用条件) Ⅲ2是概率:1/17*1/2=1/34 Ⅳ1 (儿子)是患儿的概率:1/34*1/2=1/68 原来的方法 1/2* 1/2* 1/2=1/8 Bayes方法 1/68(降低) 思考:如果Ⅳ1正常,问Ⅳ2是患儿的风险? * * 1)30岁以前发病的可能性1/3 2)30岁以前不(没有)发病的可能性2/3 3)30岁以后发病的可能性2/3 4)30岁以后不(没有)发病的可能性1/3 ? Ⅰ Ⅱ Aa (前提) 1/2 1/3+1/2 1/3 1/3+1/2 后 概 率: 1/2*1=1/2 1/2*2/3=1/3 联合概率: 1 2/3 条件概率: 1/2 1/2 前 概 率: 不是Aa(是aa) 是Aa 假 设: =0.40 =0.60 1 2? 2 1 Ⅰ Ⅱ Ⅲ Ⅳ AA*AA AA*Aa Aa*Aa 均不能生患儿,与问题不符 140/143 3/143 后概率 35/36*1 1/36*3/4 联合概率 1 3/4 条件概率 1-1/36=35/36 (2/3*1/2*1/2)*(2/3*1/2*1/2)=1/36 前概率 Ⅲ1和Ⅲ2不同为Aa Ⅲ1和Ⅲ2同为Aa 假 设 2 1 4 XAXa Ⅰ Ⅲ Ⅱ Ⅳ 16/17 1/17 后概率: 1/2*1=1/2 1/2*1/16=1/32 联合概率: 1 1/2* 1/2* 1/2* 1/2=1/16 条件概率: 1/2 1/2 前概率: Ⅱ4不是XAXa Ⅱ4是XAXa 假 设:
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