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计算机学报
第 31 卷第12 期 Vol. 31 No. 12
2008 年 12 月 CHINESE JOURNAL OF COMPUTERS Dec. 2008
背包问题 DNA 算法的反应设计及其生物实现
朱莹1) 任立红口 丁永生]).2) Kongsuwan Kritaya的
l)(东华大学信息科学与技术学庭上海 201620)
(东华大学数字化纺织服装技术教育部工程研究中心 上海 201620)
3)( 澳大利亚联邦科工组织畜牧业分部昆士兰生物科学研究基地 布里斯班 4072)
摘 要 有关背包问题的 DNA 算法近年来得到重视，文中实现了求解背包问题的并行搜索解的实验，通过最优的
方法完成有限容量背包的物品选择.展示了面向反应的 DNA 片段设计，计算过程为溶液 DNA 高效连接反应，反应
结果分别用定量(PCR) 和定性(测序)两种方法检测.文中的方法适用于多重约束条件的优化问题.
关键词 背包问题，DNA 计算s 寻|物设计，离效连接g 克隆测序
中困法分类号 TP384
DNA Ligation Design and BioJogical Realization of Knapsack Problem
ZHU Ying口 REN Li- Hong]) DING Yong-Sheng川.2) Kongsuwan Kritaya3 )
Il (College of Information Sciences and Technology , Donghua University. Shanghai 201620)
(EngineeringR.白血rch α昭re of Digitized Textile and Fashion Technology 0/Ministry of E过ucatîon ，
Donghua Uni,,,ity , Shanghai 201620)
(CSIROLi田stock lnd旧tries ， Queensland Bioscieηce Pre口nct ， St Lucia QLD 4072. Australia)
Abstract More attention has been paíd to DNA computing for Knapsack Problem (KP). The
authors realízed the bíological experíment of parallel searching to solve KP , and used the most
optimized method to select items within a limíted knapsack. The DNA fragments designing is
based on reactions and the computational procedure is high-efficiency DNA ligation. Two meth
ods were used to detect the results. They are PCR (quantitative analysis) and sequencing (quali-
tative analysis). It is suítable to the optimiz:
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