7 应用-生物信息学.ppt

生物信息学中的分类学习问题 邹 权 厦门大学计算机科学系 /main/~zq 提纲 DNA/RNA层面上的分类学习问题 蛋白质层面的分类学习问题 新技术带来的分类学习问题 几个概念： 基因、基因组、DNA、染色体、细胞 DNA如何影响生物的性状？ 什么叫表达？ 中心法则 是否所有的DNA都转录？ 人—仅仅1% 是否所有的RNA都翻译？ 真核生物的基因结构 真核细胞基因结构示意图 问题1：识别编码区(ORF) Snyder, E. E., and Stormo, G. D. (1993). Identification of coding regions in genomic DNA sequences: An application of dynamic programming and neural networks. Nucleic Acids Res. 21: 607-613. 问题2：辨别外显子、内含子 T.M. Chen, C.C. Lu, W.H. Li,(2005) Prediction of splice sites with dependency graphs and their expanded Bayesian networks, Bioinformatics, 21:471–482. 问题3：识别可变剪切 Gideon D. et al