3个奥利亚罗非鱼群体遗传多样性的RAPD分析和SCAR标记的转化.pdfVIP

第l7卷第1期 上 海 水 产 大 学 学 报 Vo1．17，No．1 2008年 1月 JOURNAL OF SHANGHAI FISHERIES UNIVERSITY Jan．．20o8 文章编号：1004—7271(2008)O1—0022—06 3个奥利亚罗非鱼群体遗传多样性的 RAPD分析和SCAR标记的转化 高风英 ，叶 星 ，卢迈新 ，黄樟翰 ，张 庭 (1．中国水产科学研究院珠江水产研究所，广东广州 510380； 2．广东海洋大学水产学院，广东湛江 524025) 摘 要：应用RAPD技术对3个奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)群体(奥利亚罗非鱼83系、新引进的红色 奥利亚罗非鱼与奥利亚罗非鱼02系)进行遗传多样性分析。根据扩增结果统计获得群体内和群体间的遗传 距离：奥利亚罗非鱼83系、红色奥利亚罗非鱼、奥利亚罗非鱼02系群体内的遗传距离分别为0．021 0，0．090 3 和0．014 9；群体间的遗传距离以奥利亚罗非鱼83系与红色奥利亚罗非鱼群体间的最大，为0．135 1，奥利亚 罗非鱼83系与奥利亚罗非鱼02系的遗传距离最小，为0．061 0，红色奥利亚罗非鱼与奥利亚罗非鱼02系群 体间的遗传距离为0．121 8。利用MEGA3．1软件进行聚类分析，奥利亚罗非鱼83系与奥利亚罗非鱼02系首 先聚为一支，然后再与红色奥利亚罗非鱼聚为一支。3个奥利亚罗非鱼群体总的Shannon多样性指数为： 0．234 0，总的Nei基因多样性指数为0．152 7，3个群体的遗传分化指数(Gst)为0．507 1。上述结果说明这3 个群体的群体内遗传变异较小，但群体间存在一定程度的遗传变异和遗传分化。对RAPD分析中所获得的6 条特异带进行SCAR转化。s97湖和$469。 两个特异片段成功转化为SCAR标记。这些标记可作为鉴别3个 奥利亚罗非鱼群体的遗传标记，并将为今后的选择育种提供分子标记。 关键词：奥利亚罗非鱼；遗传多样性；随机扩增多态DNA；SCAR标记 中图分类号：S 917 文献标识码：A RAPD analysis and SCAR transformation of three populations of Oreochromis aureus GAO Feng ying ，YE Xing ，LU Mai xin ，HUANG Zhang han ，ZHANG Ting ， (1．Pearl River Fisheries Research Institute，Chinese Academy of Fishery Sciences，Guangzhou 5 10380，China； 2．Guangdong Ocean University，Zhanjiang 524025，China) Abstract：Using RAPD technique，the genetic diversity of 3 populations of Oreochromis aureus(0．aureus，red O．aureus and blue O．aureus)was analyzed．The geneti。c distances of intrapopulation for 0．aureus，red O．aureus and blue O．aureus were 0．021．0．090．and 0．014 9．The genetic distances of interpopulation were 0．135 1．0．060 7 and 0．121 8．The maximum occurred between red O．aureus and 0．aureus，the minimum did between O．aureus and blue O．aureus．Clustering analysis with the methods of