第二章-生物分子数据库.pptVIP

SRS集成检索系统 SRS快速文本检索窗口 SRS检索结果页面显示的检索结果 SRS蛋白质记录详细内容页面 三、DDBJ数据库 日本DNA数据库DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，与NCBI的GenBank，EBI的EMBL数据库共同组成国际DNA数据库。他们开发了SQmateh工具，用来搜索基因或蛋白质中短的碱基或氨基酸序列区域，并建立了简便且易操作的SOAP(simple object aeeess protoco1)服务器。DDBJ主要收集来自日本研究者获得的序列数据，但也收集数据和发放编号给任何其他国家的研究者。 第三节 蛋白质数据库 随着分子生物学的发展，人们获得了越来越多关于蛋白质序列、结构和功能的信息。世界各国的生物学家和计算机科学家合作利用这些信息构建了蛋白质序列数据库、蛋白质三维结构数据库、蛋白质组数据库（二维凝胶电泳数据库）、信号传导及蛋白质-蛋白质相互作用相关数据库、DNA和蛋白质相互作用数据库等蛋白质相关数据库。 常用的蛋白质序列数据库： PIR MIPS Swiss-Prot（trEMBL） Present：UniProt数据库仓库 蛋白质功能、结构域和蛋白质家族有关的数据库： PROSITE InterPro Pfam ProDom SMART 等 蛋白质三维结构相关数据库： PDB Bi