作用于hiv-1 gp120小分子hiv进入抑制剂nc-2的虚拟 - scholarmate.pdf

·826 · doi 10.3969/j.issn. 1673-4254.2013.06.08 J South Med Univ, 2013, 33(6): 826-831 基础研究 作用于作用于HIV-HIV-11 gpgp120120小分子小分子HIVHIV 进入抑制剂进入抑制剂NC-NC-22 的虚拟筛选及的虚拟筛选及 其作用机其作用机制制 1 1 2 1 1 3 3 1 1 段 恒 ，王玉芹 ，宋德寿 ，陈之朋 ，裘佳寅 ，陆 路 ，姜世勃 ，刘叔文 ，谭穗懿 1 2 3 南方医科大学药学院，广东 广州 510515 ；华南农业大学资源环境学院，广东 广州 510640 ；复旦大学上海医 学院分子病毒学教育部/卫生部重点实验室，上海 200032 摘要：目的基于中和抗体VRC01 与HIV- 1 gp 120 的结合模式，利用计算机虚拟筛选，从IBS 天然产物数据库中筛选靶向HIV- 1 gp 120 的小分子HIV- 1进入抑制剂，并对其抗病毒活性和机制进行研究。方法运用MM-PBSA 方法计算候选化合物与HIV- 1 gp 120结合后自由能的变化；利用HIV- 1假病毒、活病毒技术及细胞融合实验，检测化合物抑制HIV- 1感染的活性；XTT 比色法 检测化合物对细胞的毒性；采用酶联免疫吸附测定法（ELISA）研究化合物体外抗病毒活性的机理。结果利用计算机从40 000 个化合物中虚拟筛选出19个与gp 120结合后自由能降低较大的小分子化合物，其中NC-2 具有抑制HIV- 1感染和细胞融合的活 性，其抑制HIV- 1实验株IIIB 的IC 是1.95±0.44 μmol/L ，抑制HIV- 1 假病毒的IC 是10.58±0.13 μmol/L。酶联免疫吸附法结 50 JRFL 50 果表明NC-2 体外能抑制HIV- 1 gp 120与CD4 的结合，但不抑制HIV- 1 gp41 六螺旋的形成。结论该计算机虚拟筛选的方法可 为开发作用于HIV- 1 gp 120 的小分子进入抑制剂提供参考。同时，通过计算机辅助设计加病毒活性筛选的方法，得到一个新颖 结构的HIV 进入抑制剂NC-2。 关键词：HIV- 1进入抑制剂；gp 120；VRC01 ；计算机辅助设计；药物筛选 Virtual screening of small molecular HIV- 1 entry inhibitor NC-2 targeting gp120 and its action mechanism 1 1 2 1 1 3 3 1 1 DUAN Heng , WANG Yuqin , SONG Deshou , CHEN Zhipeng , QIU Jiayin , LU Lu , JIANG Shibo , LIU Shuwen , TAN Suiyi 1School of Pharmaceutical Sciences, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China; 2 School of Resources and Environmental Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510640, China; 3Key Laboratory of Medical Molecular Virology of Ministry of Education/Minist