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基于文献挖掘的前列腺癌蛋白组学与基因组学差异基因的生物信息学
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文献 数据研究分享
基于文献挖掘的前列腺癌蛋白组学与基因组学差异基因的
生物信息学分析
， ， ， ， ， ， ， ， ，
陈 晨 曹笑歌 张立国 么安亮 刘 健 康绍叁 高伟兴 韩 会 曹凤宏 李治国
【 】 (PCa) ， PCa
摘要 目的 通过前列腺癌 蛋白组学与基因组学文献 挖掘与 存在相关性并缺乏具体研究的差
， 。 PubMed ， : “(prostate cancer ［Title ］)
异基因 并分析其参与的生物过程与通路 方法 计算机检索 数据库 检索策略
AND Proteomics”“ (prostate cancer ［Title ］)AND Genomics”， 20 15 1 。 PCa
时间限定为建库至 年 月 按照 与前列腺增生
(BPH) (A )、PCa (B )、PCa Gleason Gleason (C )
组织 组 与邻近良性组织 组 高 评分与低 评分 组 蛋白谱和基因谱的
， “The Protein Information Ｒesource (PIＲ ，Georgetown University Medical Center ，
比较提取差异蛋白或基因 输入
Washington ，DC 20007 ，USA)”， “official gene symbol ” 。 “DAVID Bioinformatics Ｒesources 6. 7
按照 统一名称 采用
(National Institute of Allergy and Infectious Diseases，NIH，USA )” 在线工具对差异基因进行 GO (Gene Ontology )、
KEGG 。 35 ， 764 ， A 162 ，B
等生物信息学分析 结果 共纳入 篇文献 提取差异基因 个 其中 组差异基因 个 组差异基因
423 ，C 209 ，3 21 。A DES ， 6 ;B ACPP
个 组差异基因 个 组共同差异基因 个 组差异基因中 报道最多 为 次 组差异基因
， 4 ;C ACTN1、HSPB1、LMNA ， 3 。GO ，
报道最多 为 次 组差异基因 报道最多 均为 次 分析结果显示 差异基因涉及的
、 、 、 、
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