生物信息学（bioinformatics）.pptVIP

研究内容： 我们常遇到的问题 序列如何获得？ 1、已存在的序列--------SRS、ENTRAZ 2、ESTs库中克隆新基因-------stackPACK、Esmachine * 生物信息学产生背景： 生物学和医学的迅速发展，特别是人类基因组计划的巨大成就，人类已获得大量的生物分子数据，并且其积累速度在不断地增加。 生物信息学（Bioinformatics）  以信息科学和技术为手段，以计算机和计算机网络为主要工具，研究和开发生物信息，从而为生命科学和生物技术各个领域服务的一门新的交叉学科。核心是基因组信息学。 蛋白识别： 1、一级结构分析：信号肽、磷酸化位点、糖基化位点等。 2、高级结构分析：同源建模等。 基因识别: 1、哪些是基因序列？ 2、Transcription factors 结合在何区域？ 3、start codon 、stop codon、splicing sites 在何处？ 4、翻译成何种蛋白？ * GENBANK PIR 文献检索 PubMed EMBL SwissProt 生物信息数据库 DDBJ ……… 生物信息(蛋白、核酸)的 GDB 收集、储存、管理与提供 以Internet为基础的生物信息学传输网络 CBI CBI.PKU …… 新基因的 电子克隆：利用ESTs库发现新基因 发现与鉴定 与别的序列进行比较 Blast 对测序数据进行基因识别 基因组序列 功能模式检测-----各种软件包 信息的提取 非编码区信息结构分析 与别的序列进行比较 Blast 和分析 功能模式检测-----各种软件包 蛋白质一级序列分析 蛋白质序列 蛋白质高级结构建模：参考已知空间结构的同源蛋白进行构建 信息的提取 以蛋白质结构为基础的小分子药物设计 鉴定蛋白并确定之结构 和分析 根据三维模型设计药物 化学合成和生物鉴定 定义结构