不同宿主h1n1 病毒血凝素蛋白(ha)受体结合位点的变异特征.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2010 7 , 32(7): 701―711 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00701 不同宿主H1N1 病毒血凝素蛋白(HA)受体结合位点的 变异特征 1 1 2 傅天韵 , 娄维义 , 石铁流 1. , 201203; 2. , 200062 2009 年全球性爆发的H1N1 病毒已经导致213 个国家和地区受到感染, 有 16 226 人死亡。病毒与宿主细 胞表面受体的结合是病毒感染不可缺少的第一步, 从而导致病毒膜与宿主细胞膜的融合。血凝素(Hemagglutinin, HA)就是介导这种受体结合与膜融合的病毒蛋白, 受体结合位点(Receptor binding sites, RBSs)位于HA 蛋白三聚 体中每个单体的球形头部, 主要由 190 位螺旋(190~198aa) 、130 位环(135~138aa)和220 位环(221~228)3 个二级 结构域组成。文章收集了 1918~2009 年间 1 221 株H1N1 病毒株的HA1 序列(长度为327 个氨基酸残基), 通过 序列比对、各位点氨基酸残基的熵值以及3D 结构模拟等生物信息学研究。结果显示不同宿主的不同病毒RBSs 具有不同的熵值, 而且不同宿主的病毒HA1 其 RBSs 具有不同的优势序列。3D 结构模拟也显示了H1N1 不同 HA1 之间在 190 位螺旋构象上的细微差异。该研究揭示了不同HA1 上RBSs 的一些新的特征, 为进一步探讨病 毒感染的机理提供了新的信息。 H1N1 流感病毒; 受体结合位点; 变异特征; 生物信息学分析 Variation feature of receptor binding sites of H1N1 influenza hemagglutinin in different hosts 1 1 2 FU Tian-Yun , LOU Wei-Yi , SHI Tie-Liu 1. No . 2 High School of East China Normal University, Shanghai 201203, China; 2. School of Life Sciences, East China Normal University, Shanghai 200062, China Abstract: Recent outbreak of H1N1 virus worldwide has caused 16 226 deaths in over 213 countries and districts. Bind- ing between the virus and the receptor on the host cell surface is the key initial event for the infection, which results in the fusion of viral host cell membrane. Hemagglutinin (HA) is the viral protein that mediates the receptor binding and mem- brane fusion. The receptor binding sites (RBSs) are located at the membrane-distal part of each subunit of the HA trimer and are formed by three secondary structure elements, 190 hel