长链非编码rna与心脏发育和心血管疾病 于 硕 马 宏 项美香 基金项目 .docVIP

长链非编码RNA与心脏发育和心血管疾病 于 硕 马 宏 项美香 基金项目：国家自然科学基金资助项目81270179） 作者单位：310009 浙江杭州，浙江大学医学院附属第二医院麻醉手术部（于硕），心血管内科（马宏、项美香） 通信作者：项美香，电子邮箱为xiangmxhz@163.com 心脏是胚胎发育中第1个形成并发挥功能的器官，为血液循环持续提供动力，以满足随机体发育而不断增长的循环和代谢需求。心脏经历了生心细胞分化、心管发生、心脏环化、左右不对称发育和室腔形成等独特发育阶段，最终形成由心肌细胞、自律细胞、成纤维细胞、内皮细胞等多种细胞类型组成的高度功能化的复杂三维生物组织。从昆虫到哺乳动物的进化研究[1]中发现，心脏发育受到Hand、Nkx、GATA、Tbx等高度保守基因的精细调控，并依赖这一基因网络对各种生理和病理刺激作出迅速有效的响应，基因调节异常将引起心脏功能和结构缺陷，从而导致多种心血管疾病。研究心脏基因调控网络将有助于揭示心脏发育和心血管疾病的分子机制，为新的靶向性临床治疗措施提供实验依据[2]。 人类基因组约有30亿对碱基，包含了调控器官发育和功能的大量遗传信息。生物信息的传递有赖于基因组、表观组、转录组和蛋白组的协调统一，这需要一个巨大且精细的调节机制整合不同层次的分子信息网络。人类基因组计划和DNA元件百科全书计划(Encyclopedia of DNA Elements， ENCODE)ENCODE（有无中文全称，如果没有，请补充英文全称）计划发现，超过98%的基因组序列会被转录，但仅有约1.5%参与编码氨基酸，大量非编码RNA是基因网络的重要调控元件[3-4]。其中，长于200个核苷酸的长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是非编码RNA的主要组成部分[5]，分布于特定亚细胞结构中，具有时间和组织表达特异性，提示lncRNA在控制器官发育和维持生理功能中可能发挥重要作用[3]。本文旨在对lncRNA的分子机制及其在心脏发育和心血管疾病中的作用做一综述。 1 lncRNA的生物学特征和分类 lncRNA广泛分布于基因组中，其基因结构和转录机制与信使RNA（messenger RNA, mRNA）类似[3]。lncRNA主要由RNA聚合酶II转录合成，具有RNA聚合酶II相关的染色质标志、5’端帽子和3’端多聚腺苷酸尾结构，并可产生多种剪接形式[6]。但不同于蛋白编码基因，lncRNA不具备开放阅读框（open reading frame，ORF）(下文未再出现该英文术语，故删除)，其密码子具有随机性，无法编码蛋白质[6-7]。由于lncRNA具有RNA聚合酶II产物的一般特征，由此推测极有可能存在多种内源性调节分子，促进lncRNA的生物合成、降解和维持其稳定性[8-9]，但其具体机制尚待进一步深入研究。 根据上述生物学特征，结合RNA-Seq测序和Tiling Array芯片技术可以定位和发现大量lncRNA[10]。目前在小鼠和人类中已分别发现超过3万个lncRNA[11-12]，根据它们与蛋白编码基因的相对位置关系[11,13]，上述已知lncRNA可分为以下5种：①正义型，与蛋白编码基因的外显子有部分重叠；②反义型，与蛋白编码基因的外显子呈部分互补；③内含子型，位于蛋白编码基因的内含子中；④双向型，与蛋白编码基因紧密相邻，但转录方向相反；⑤基因间型，与邻近蛋白编码基因的距离在5 kb以上[10]（图1）。 图1 lncRNA与蛋白编码基因的位置关系和分类（图是参考文献10中的吗，不方便排版，如果可以，最好删去）（图1不是参考文献10中的，只是为了让分类描述更形象，已删除） 2 lncRNA的生物学功能 lncRNA能够与DNA或多种RNA[信使RNA（mRNA（前文已经出现该术语全称及缩写）、微小RNA（microRNA）等]形成核酸复合体，同时具备与蛋白质结合并调节其活性的能力，因而lncRNA可能在基因网络的多个调控层次发挥作用。目前已发现lncRNA在基因的表观遗传调控、转录、转录后调节和蛋白代谢中均发挥重要作用。 lncRNA可通过募集染色质修饰蛋白调控基因表达。Paul和Duerksen在1975年就发现染色质中含有大量RNA，其数量甚至为DNA的2倍，提示RNA可能影响染色质结构[14]，但直到近年才发现lncRNA可能是这一关键的调节性RNA。哺乳动物中X染色体的剂量补偿是维持雌雄两性生物基因表型一致的重要遗传效应，但是机体如何使雌性动物其中1条X染色体的遗传性状失活，其分子机制尚不完全清楚。由X染色体转录出的X染色体失活特异转录本（X-inactive speci?c transcript, Xist）能够募集