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精选4章 蛋白质的共价结构-教学用
Insoluble polystyrene bead Attachment of carboxyl-terminal amino acid to reactive group on resin. Protecting group is removed by flushing with solution containing a mild organic base. ②去保护基 ①连接 * Dicyclohexylcarbodiimide (DCC) Amino acid 2 with protected α-amino group is activated at carboxyl group by DCC. ③ 活化 * α-amino group of amino acid 1 attacks activated carboxyl group of amino acid 2 to form peptide bond. Dicyclohexylurea byproduct Completed peptide is deprotected as in reaction②; HF cleaves ester linkage between peptide and resin. ④ 缩合 ⑤ 裂解 * 不溶性树脂 连接:α-氨基被保护的氨基酸1与树脂的反应基团连接 去保护基:用CF3COOH/CH2Cl2冲洗并用二异丙乙胺/CH2Cl2中和 异丁烯+CO2 异丁烯+CO2 (在CH2Cl2中) 活化:氨基酸2与DCC反应形成活化酯 缩合:氨基酸1的α-氨基进攻氨基酸2的被活化的羧基形成肽键 N,N′-二环己基脲 裂解:去保护基并用HF/CH2Cl2断裂肽与树脂间的酯键 (根据需要重复②到④) * 作业题:第4、7、8三题 基本要求: 掌握肽键的结构特点 掌握肽的理化性质 掌握蛋白质测序的一些常用方法 可以书山有路勤为径,不要学海无涯苦作舟!! * 蛋白质是生物功能的主要载体: 蛋白质的共价结构 第 4 章 * 一、蛋白质的分子大小 二、蛋白质结构的组织层次 三、肽 四、蛋白质测序的策略 五、蛋白质测序的一些常用方法 六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基 七、蛋白质一级结构的举例 八、蛋白质序列数据库 九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成 教学内容 * 一、蛋白质分子的大小 蛋白质Mr的范围: 6 000 ~ 1×106,下限一般认为从胰岛素(Mr 5 733)。 肽、蛋白质的一般区别: 一般情况,少于 50 个 氨基酸残基的低分子量 氨基酸多聚物为肽,寡肽或生物活性肽,有时也罕称多肽;多于50个氨基酸残基的称为蛋白质。有时把含有一条肽链的蛋白质不严谨地称为多肽。 多肽一词着重于结构,而蛋白质原则强调了其功能。 * 一、蛋白质分子的大小 单体蛋白、寡聚蛋白或多聚蛋白、亚基超分子复合体 * 对简单蛋白质,用 110 除它的 Mr 即可约略估计其氨基酸残基的数目。 蛋白质中 20 种基本 aa 平均 Mr 约 138,但多数蛋白质较小氨基酸占优势,平均 Mr 接近 128。形成一个肽键将除去一分子H2O),所以氨基酸残基的平均 Mr 约为110 一、蛋白质分子的大小 氨基酸残基数目的估算 * 一、蛋白质的分子大小 二、蛋白质结构的组织层次 三、肽 四、蛋白质测序的策略 五、蛋白质测序的一些常用方法 六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基 七、蛋白质一级结构的举例 八、蛋白质序列数据库 九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成 教学内容 * 二、蛋白质结构的组织层次 一级结构:多肽链的氨基酸序列,包括共价键。 二级结构:多肽链借助氢键形成的有规则的局部结构,如α螺旋、β折叠等元件。 三级结构:借助次级键形成特定走向的球状实体. 四级结构:亚基借助非共价键彼此缔合成寡聚或多聚蛋白质. * 一、蛋白质的分子大小 二、蛋白质结构的组织层次 三、肽 四、蛋白质测序的策略 五、蛋白质测序的一些常用方法 六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基 七、蛋白质一级结构的举例 八、蛋白质序列数据库 九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成 教学内容 * (一) 肽和肽键的结构 (二) 肽的物理和化学性质 (三) 天然存在的活性肽 三、肽 * 肽:是由一个氨基酸的羧基和另一个氨基酸的氨基脱水缩合而成的化合物. 肽键:氨基酸间脱水后形成的共价键称肽键(酰氨键), 氨基酸→氨基酸残基. 二肽:两个氨基酸,寡肽:2-10个氨基酸,多肽多于10个氨基酸. (一)肽键的结构 * (一)肽键的结构 氨基末端(残基) 羧基末端(残基) 酰胺基称为肽基或肽单位 多肽链主链:肽链骨架由-N-Cα-C-重复排列而成 * (一)肽键的结构 酰胺氮上的孤对电子与羰基
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