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第十章基因组和比较基因组学2012.5.31
第十章;目录;20世纪人类科技发展史上的三大创举;*;*;*;2000年4月6日 美国塞莱拉公司宣布破译出一名实验者的完整密码,但遭到不少科学家的质疑。
2000年4月底 中国科学家按照国际人类基因组计划的部署,完成了1%人类基因组的工作框架图。
2000年5月8日 德、日等国科学家宣布,已基本完成了人体第21对染色体的测序工作。
2000年6月26日 科学家公布人类基因组工作草图,标志着人类在解读自身“生命之书”的路上迈出了重要一步。
2000年12月14日 美英等国科学家宣布绘出拟南芥基因组的完整图谱。这是人类首次全部破译出一种植物的基因序列。
2001年2月12日 中、美、日、德、法、英6国科学家和美国塞莱拉公司联合公布人类基因组图谱及初步分析结果。 科学家首次公布人类基因组草图“基本信息”。;*;第一节 人类基因组计划;一、人类基因组计划的科学意义
二、遗传图的绘制
三、物理图(Physical Map)
四、转录图(Expression Profiling)
五、人类基因组的序列图(Human Genome Sequence)
;*;基因控制着细胞中的蛋白质合成,控制着生物的各种遗传性状。基因组是生物体内遗传信息的集合,是某个特定物种细胞内全部DNA分子的总和。人体是一个多细胞体系,每个细胞中都包含46条两两配对的染色体,每23条染色体构成一个染色体组。大约有30亿对核苷酸,编码了5-6万个基因,人类基因组中携带了有关人类个体生长发育、生老病死的全部遗传信息。从整体上看,不同人类个体的基因是相同的,因此,我们说“人类只有一个基因组”,人生来是平等的。当然,不同的人可能拥有不同的等位基因,这一点决定了人与人之间个体上的差异。
;各种遗传病的发生,都源于基因的突变。突变是基因在分子结构上的改变,这种DNA分子结构的改变会导致基因功能的异常,从而导致遗传病。例如人类2号染色体长臂某段DNA分子的改变,就会导致并指畸形的产生。至于一些复杂的疾病,如高血压、冠心病、糖尿病、癌等,则可能涉及多个基因的突变。
;一、人类基因组计划的科学意义;*;(6)研究DNA突变、重排和染色体断裂等,了解疾病的分子机制,包括遗传性疾病、易感性疾病、放射性疾病甚至感染性疾病引发的分子病理学改变及其进程,为这些疾病的诊断、预防和治疗提供理论依据。
(7)确定人类基因组中转座子、逆转座子和病毒残余序列,研究其周围序列的性质。了解有关病毒基因组侵染人类基因组后的影响,可能指导人类有效地利用病毒载体进行基因治疗。(8)研究染色体和个体之间的多态性。这些知识可被广泛用于基因诊断、个体识别、亲子鉴定、组织配型、发育进化等许多医疗、司法和人类学的研究。此外,这些遗传信息还有助于研究人类历史进程、人类在地球上的分布与迁移以及人类与其他物种之间的比较。
;*;*; 通过遗传图分析,我们可以大致了解各个基因或DNA片段之间的相对距离与方向,了解哪个基因更靠近着丝粒,哪个更靠近端粒等。遗传距离是通过遗传连锁分析获得的,研究中所使用的DNA标志越多,越密集,所得到的遗传连锁图的分辨率就越高。
经典的遗传标记是可被电泳或免疫技术检出的蛋白质标记,如红细胞ABO血型位点标记,白细胞HLA位点标记等。例如,在ABO血型基因中,位于9号染色体长臂3区4带(9q34)的基因IA,决定抗原A的存在,表现A型血性状。由于ABO血型的广泛存在,所以可用它作遗传标记。
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当在某一家庭中,观察到了指甲髌骨综合征与A型血相伴遗传时,科学家就认为,这种病的致病基因NP与IA基因相连锁,也位于9q34区段。进一步的观察发现,这个家庭的后代中,有1/10为A型血而无指甲髌骨综合征,这表明基因IA和NP发生了交换,交换率(重组率)为1/10。这时就可说,基因IA和NP相距较近,连锁图上的距离为10厘摩(重组率1%即为1厘摩)。;*;*;第二代DNA遗传标记利用了存在于人类基因组中的大量重复序列,包括重复单位长度在15-65个核苷酸左右的小卫星DNA(minisatellite DNA),重复单位长度在2-6个核苷酸之间的微卫星DNA(microsatellite DNA),后者又称为简短串联重复(STR、STRP或SSLP,short tandem repeat polymorphism或者simple sequence length polymorphism)。
STRP有两个最突出的优点,即作为遗传标记的“多态性”与“高频率”。STR的存在,为遗传图的绘制提供了大量可用的遗传标记。采用聚合酶链反应(PCR)技术,以STR两侧的基因作定点标记的完整连锁图,已于1996年绘成,相邻标记间的平均距离仅0.7厘摩。;第三代DNA遗传标记,可能也是
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