猪2号染色体MYOD1区域的RH定位和连锁定位.pdfVIP

No．2 第31卷第2期 湖北大学学报(自然科学版) V01．31 2009年6月 ofttubei Science) Jun．，2009 Journal University(Natural 文章编号：1000—2375(2009)02—0172～04 猪2号染色体MYODl区域的 RH定位和连锁定位 邱海芳，樊斌，徐学文，刘榜 (华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，湖北武汉430070) 摘要：在已经定位的QTL区域中开展基因连锁定位是寻找候选基因的重要途径．运用比较基冈组方法筛 选_}{{猪2号染色体上生长、胴体和肉质性状QTL区域中与肌肉发育相关的5个基因(脚DJ、LDHA、 cM)一 的顺序进行了比较．结果表明这5个基因在猪2号染色体上的排列顺序和距离是：㈣翻(75．2 LDHA(79cM)一CSRP3(83．8cM)一TEF-】(86．5cM)一COPBI(90cM)，猪与小鼠基因的顺序相同，而与人 奠定了基础． 关键词：猪；MYODl；RH定位；连锁定位 中图分类号：Q343．1+7文献标志码：A DOI：10．3969／j．issn．1000—2375．2009．02．016 1 引言 目前，国际上有3个主要的猪遗传连锁图谱：欧洲猪基因图谱规划协作组(PiGMaP)、美国农业部肉 畜研究中心(USDA—MARC)和瑞典Scandinavian科研组构建的图谱．2000多个基因和标记已被定位 286．2 到猪遗传图谱上．最新版的猪遗传连锁图谱上微卫星标记共计l042个，总长度2 cM，标记间平 均距离为2．23cM．基于这些遗传图谱，影响猪重要经济性状的主效基因或QTLs在不同染色体上得到 了检测．对已定位的QTL的分布进行分析发现，背膘厚和日增重的QTL集中在1、2、4、7染色体 于短臂远端，LeifAnderson鉴定出候选基因IGF2，在此基因的调控区发现影响肌肉生长和背膘厚性状 的致因突变[1]．第二区域推测位于55—67cM区段[2。3]，但到目前为止，还没有发现与这些重要性状相关 MYOD／是启动和维持骨骼肌细胞增殖和分化的一个主要调控基因，在骨骼肌发育过程中发挥了重要 作用L 用[6]，TEF-1可以直接或间接调节肌肉特异基因的表达，因此我们推测此区域有影响猪生长和胴体性 状的重要候选基因存在． 筛选与肌肉生长发育相关的基因，开展RH定位和连锁定位．研究结果对密集My0DI所在区域的标 记，弄清该区域基因的连锁关系和候选基因的筛选具有重要意义． 2材料与方法 2．1候选基因的筛选根据人11号染色体短臂与猪2号染色体2p14—17同源区域进行分析，查找与 收稿日期：2008—11—28 基金项目：国家自然科学基金资助 hzatredu．en 作者简介：邱海芳(1981一)，女。博士生；刘榜，通讯作者．Tel：027-Email：liubanlIg@rmiL 第2期 邱海芳等：猪2号染色体脚功区域的RH定位和连锁定位 173 肌肉发育相关的候选基因： 程中发挥了重要作用，推断与啪DI紧密连锁的基因在猪的肌肉生长发育中可能具有重要作用．猪2 查询发现TEp】一My，0D】一CSRP3连锁群中有78个基因存在． 78个基因的信息，筛选出分别与细胞周期、细胞增殖和分化及能量代谢与蛋白质转运等相关的18个基 c0PBj在从高尔基体到内质网逆行转运蛋白和从高尔基体回收双亮氨酸标签蛋白到内质网的过 程中发挥了重要作用[8]．L