生物信息学关于plant rnase p.pdf

生物信息学 关于PlantRNaseP 姓名：汪利军 学号：3140105707 专业：统计学 January10,2017 生物信息学 1/7 1 什么是RNaseP RNase 是Ribonuclease 的缩写，中文名为核糖核酸酶，它是一种催化RNA 降 解成较小组分的核酸酶。核糖核酸酶可以分为内切核糖核酸酶和外切核糖核酸 酶，并且包括EC2.7 （对于磷酸裂解酶）和EC3.1 （对于水解酶）类别中的几个 子类。 Figure1: 核糖核酸酶 而RNaseP 是RibonucleaseP 的缩写，中文名为核糖核酸酶P，是一种核糖核 酸酶。RNaseP 不同于其他RNase，因为它是核酶，即由一个RNA 分子发挥催化 活性，它是第一个被发现的蛋白质以外具有催化活性的生物大分子。它的功能是 在tRNA 分子上切割额外的或前体的RNA 序列。此外，RNase P 是自然界中两 种已知的多个周转核酶之一（另一个是核糖体），它的发现使得SidneyAltman 和 Thomas Cech 在 1989 年获得诺贝尔化学奖：在20 世纪70 年代，Altman 发现了 前体tRNA 的存在与侧翼序列，并且是第一个表征核糖核酸酶P 及其在加工前体 tRNA 的5’ 前导序列中的活性。最近新的研究成果表明，RNaseP 具有新的功能。 已经表明人类核RNA 酶P 是各种小的非编码RNA 如tRNA,5S rRNA, SRP RNA 和U6snRNA 基因的正常和有效转录所需的，其由RNA 聚合酶III 转录，其中之 一是人类细胞中的三种主要RNA 聚合酶。 1 生物信息学 2/7 Figure2: RNaseP 2 RNaseP 的类型 RNaseP 主要存在于细菌中，古菌中，以及真核生物中。 在细菌中，如大肠杆菌，RNaseP 具有两个组分：一条RNA 链（称为M1-RNA） 和一个蛋白质（称为C5 蛋白）。在细胞内，这两个组分对于功能的发挥都是必 要的；但在体外，M1-RNA 可以独自发挥催化的功能。C5 蛋白的作用主要是增 强底物结合的亲和力，而活性位点金属离子结合亲和力的提高很可能能够加强 M1-RNA 的催化速率。细菌RNaseP 的晶体结构显示它具有一个由共轴堆积的螺 旋结构域构成的平整表面，这样一个平的表面有助于底物前体tRNA 分子的结合 和剪切。 2 生物信息学 3/7 Figure 3: 细菌的RNaseP 类别A Figure4: 细菌的RNaseP 类别B 在古菌中，RNaseP 含有4-5 个结合RNA 的蛋白质亚基。体外重构实验显示， 这些亚基中的每一个都通过RNase P 中的RNA 组分参与对于tRNA 的处理。古 菌RNaseP 中的蛋白质亚基结构已经通过X 射线晶体学和NMR 被解析，进一步 揭示了这些亚基结构与功能的关系。 在真核生物中，如人类和酵母，RNase P 的RNA 链与细菌中所发现的在结 构上相似，并含有9-10 个与RNA 链结合的蛋白质亚基，其中5 个亚基与古菌 RNaseP 中的5 个亚基具有同源性。这些亚基同时也是RNaseMRP （RNaseMRP 是一种催化性核糖核蛋白，参与细胞核中核糖体RNA 的剪切）的组成亚基。真 核生物的RNase P 中的RNA 组分直到最近才被证明是核酶；其蛋白质亚基自 身对于底物tRNA 的剪切只具有次要作用，这些亚基可能是在RNase P，RNase MRP 的其他功能（如基因转录和细胞周期）中发挥主要作用。 3 RNaseP 的发现 RNase P 的发现者是Sidney A