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Bionano 送样建议 文件编号： SOP-SMM-019 版本号： A0 生效日期： 2016-8-19 Bionano 送样建议 文件编号：SOP-SMM-019 版本号：A0 第1 页 共12 页 目录 第一章 样品要求2 1.1 术语介绍2 1.1.1 计量单位2 1.1.2 质检方法2 1.2 核酸样品要求2 1.2.1 样品具体要求2 1.2.2 样品打包及寄送2 1.3 组织样品要求3 1.3.1 植物样本要求3 1.3.2 动物样本要求6 1.3.3 昆虫样本要求8 1.3.4 海洋生物样本8 1.3.5 微生物样本要求9 第二章 样品打包及寄送 11 附录A 修订记录 12 Bionano 送样建议 文件编号：SOP-SMM-019 版本号：A0 第2 页 共12 页 第一章 样品要求 1.1 术语介绍 本文档使用以下术语： 1.1.1 计量单位 1) v ：体积（Volume ），样品（溶液）体积。 2) m：总量（Total Mass ），DNA/RNA 总量。 3) c：浓度（Concentration ），DNA/RNA 浓度。 4) M ：Molar Concentration ，DNA/RNA 的摩尔浓度（精确定量）。 5) OD260/280：OD260/280 比值，DNA/RNA 检测中260 与280 吸光值比值，反映 DNA/RNA 纯度。 6) OD260/230：OD260/230 比值，DNA/RNA 检测中260 与230 吸光值比值，反映 DNA/RNA 纯度。 7) OD600：某种溶液在600nm 波长处的吸光值，反映细菌细胞密度。 1.1.2 质检方法 1) Invitrogen Qubit®Fluorometer 2) Thermo Fisher NanoDropTM ND-1000/ND-8000 3) Agarose Gel Electrophoresis (AGE) 4) Pulsed Field Gel Electrophoresis （PFGE ） 1.2 核酸样品要求 1.2.1 样品具体要求 不建议直接寄送 DNA 溶液，建议寄送包埋有核酸/细胞/原生质体的琼脂糖块（Agarose Plug ），并且该Plug 已经进行了蛋白酶K 、RNase 消化处理。推荐使用Bio-Rad CHEF Mammalian Genomic DNA Plug Kit (Cat #170-3591)进行该处理。 A. Plug 包含量：4-6μg DNA/ Plug ，2~3 个Plug 。 B. DNA 主带要求≥400kb ，最低≥250kb ，浓度要求40-200ng/μL。 如下脉冲电泳图(见图1)中6 号样品符合要求。 1.2.2 样品保存 Bionano 送样建议 文件编号：SOP-SMM-019 版本号：A0 第3 页 共12 页 Plug 置于 1xWash