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五个地方绵羊品种FAS基因3′-UTR区单核苷酸多态-中国农业科学.PDF
中国农业科学 2010,43(13):2784-2792
Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.13.019
五个地方绵羊品种FAS基因3′-UTR区单核苷酸多态性研究
1,2 2 2 3 2 3 2 2 1
杨具田 ,徐红伟 ,臧荣鑫 ,蔡 勇 ,卢建雄 ,曹 忻 ,霍生东 ,刘根娣 ,吴建平
1 2 3
(甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070 ; 西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030 ; 西北民族大学实验中心,兰州 730030 )
摘要:【目的】探究脂肪酸合成酶(FAS)基因 3′端非翻译区(3′-UTR)在绵羊地方品种中的遗传多态性,为
进一步揭示地方绵羊品种间遗传分化、开展肉质性状的关联分析和表达调控等研究提供依据。【方法】采用PCR-SSCP
和 DNA 测序技术对兰州大尾羊(38 只)、滩羊(58 只)、甘加羊(40 只)、欧拉羊(30 只)和乔科羊(39 只)五
个地方绵羊品种 205 只个体的脂肪酸合成酶(FAS)基因 3′-UTR 进行单核苷酸多态性(SNPs)检测和遗传多态性
分析。【结果】在这五个地方绵羊品种的 FAS 基因 3′-UTR 区中,有 951 位点和 1 005 位点 2 个多态位点;两位点
分别存在AA、Aa、aa和EE、Ee、ee各三种基因型,而aa 和 ee基因型未检测到;AA和EE 基因型频率高于Aa和
Ee 基因型频率,基因型 AA 和 EE 为优势基因型;A 和 E 两个等位基因频率高于 a 和 e 等位基因频率,为优势等位
基因。适合性检验表明,这 5个地方绵羊品种在951位点和1 005位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。独立性
检验表明:在 951 位点,兰州大尾羊与滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异显著(0.01<P <0.05);
滩羊与欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异极显著(P <0.01);欧拉羊、甘加羊和乔科羊,甘加羊与乔科羊
均表现为差异不显著(P >0.05);在 1 005 位点兰州大尾羊、滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊品种之间均表现为
差异不显著(P >0.05)。测序结果表明,951 位点在 FAS 基因在其转录产物 mRNA 的 951 位所对应处有一处 C→T
突变;1 005 位点在 FAS 基因在其转录产物 mRNA 的 1 005 位所对应处有一处 A→G 突变。FAS 基因 mRNA 二级结构
预测结果显示:951位点的突变能导致其二级结构发生了明显的改变,而1 005突变不会改变其二级结构。【结论】
五个地方绵羊品种在 FAS 基因 3′-UTR 区有 951 位点(C→T)和 1 005 位点(A→G)两个 SNPs,2 位点均处于
Hardy-Weinberg平衡状态;基因型频率分布的独立性检验结果表明,在951位点,兰州大尾羊与滩羊、欧拉羊、
甘加羊和乔科羊之间表现为差异显著(0.01<P <0.05);滩羊与欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异极显著
(
P <0.01);欧拉羊与甘加羊和乔科羊、甘加羊与乔科羊均表现为差异不显著(P >0.05);在 1 005 位点兰州大
尾羊、滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊品种之间均表现为差异不显著(P >0.05)。
关键词:绵羊;脂肪酸合成酶基因;单核苷酸多态性
Polymorphism of 3′-UTR of Fatty Acid Synthase (FAS)
Gene in Five Chinese Sheep Breeds
1,2 2
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