五个地方绵羊品种FAS基因3′-UTR区单核苷酸多态-中国农业科学.PDF

中国农业科学 2010,43(13):2784-2792 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.13.019 五个地方绵羊品种FAS基因3′-UTR区单核苷酸多态性研究 1,2 2 2 3 2 3 2 2 1 杨具田 ，徐红伟 ，臧荣鑫 ，蔡 勇 ，卢建雄 ，曹 忻 ，霍生东 ，刘根娣 ，吴建平 1 2 3 （甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070 ； 西北民族大学生命科学与工程学院，兰州 730030 ； 西北民族大学实验中心，兰州 730030 ） 摘要：【目的】探究脂肪酸合成酶（FAS）基因 3′端非翻译区（3′-UTR）在绵羊地方品种中的遗传多态性，为 进一步揭示地方绵羊品种间遗传分化、开展肉质性状的关联分析和表达调控等研究提供依据。【方法】采用PCR-SSCP 和 DNA 测序技术对兰州大尾羊（38 只）、滩羊（58 只）、甘加羊（40 只）、欧拉羊（30 只）和乔科羊（39 只）五 个地方绵羊品种 205 只个体的脂肪酸合成酶（FAS）基因 3′-UTR 进行单核苷酸多态性（SNPs）检测和遗传多态性 分析。【结果】在这五个地方绵羊品种的 FAS 基因 3′-UTR 区中，有 951 位点和 1 005 位点 2 个多态位点；两位点 分别存在AA、Aa、aa和EE、Ee、ee各三种基因型，而aa 和 ee基因型未检测到；AA和EE 基因型频率高于Aa和 Ee 基因型频率，基因型 AA 和 EE 为优势基因型；A 和 E 两个等位基因频率高于 a 和 e 等位基因频率，为优势等位 基因。适合性检验表明，这 5个地方绵羊品种在951位点和1 005位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。独立性 检验表明：在 951 位点，兰州大尾羊与滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异显著（0.01＜P ＜0.05）； 滩羊与欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异极显著（P ＜0.01）；欧拉羊、甘加羊和乔科羊，甘加羊与乔科羊 均表现为差异不显著（P ＞0.05）；在 1 005 位点兰州大尾羊、滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊品种之间均表现为 差异不显著（P ＞0.05）。测序结果表明，951 位点在 FAS 基因在其转录产物 mRNA 的 951 位所对应处有一处 C→T 突变；1 005 位点在 FAS 基因在其转录产物 mRNA 的 1 005 位所对应处有一处 A→G 突变。FAS 基因 mRNA 二级结构 预测结果显示：951位点的突变能导致其二级结构发生了明显的改变，而1 005突变不会改变其二级结构。【结论】 五个地方绵羊品种在 FAS 基因 3′-UTR 区有 951 位点（C→T）和 1 005 位点（A→G）两个 SNPs，2 位点均处于 Hardy-Weinberg平衡状态；基因型频率分布的独立性检验结果表明，在951位点，兰州大尾羊与滩羊、欧拉羊、 甘加羊和乔科羊之间表现为差异显著（0.01＜P ＜0.05）；滩羊与欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异极显著 （ P ＜0.01）；欧拉羊与甘加羊和乔科羊、甘加羊与乔科羊均表现为差异不显著（P ＞0.05）；在 1 005 位点兰州大 尾羊、滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊品种之间均表现为差异不显著（P ＞0.05）。 关键词：绵羊；脂肪酸合成酶基因；单核苷酸多态性 Polymorphism of 3′-UTR of Fatty Acid Synthase (FAS) Gene in Five Chinese Sheep Breeds 1,2 2