分析微生物多样性-yzxzcom.PPT

水稻品种内生微生物生物标记的研究 胡桂萍 2007级植物检疫 汇报内容 立题依据 ● 水稻品种标记研究简介 ● 磷脂脂肪酸法在微生物多样性研究上应用 ● 植物内生菌的研究进展 研究内容 ● 不同水稻品种内生菌多样性研究 ● 不同水稻品种脂肪酸生物标记研究 研究方法和技术路线 本项目的特色和创新之处 预期目标 立体依据 一、水稻品种标记研究现状 水稻品种标记种类有形态学标记，细胞标记，生化标记和分子标记等。 分子标记是当今水稻品种标记使用最广，方便快捷的方法。 分子标记现在主要有RFLP，SSR，RAPD，SNP。 二、磷脂脂肪酸法在微生物学领域的应用 1.微生物研究方法 2.磷脂脂肪酸法在微生物学领域的应用进展 微生物研究方法 1.琼脂培养基培养方法 2.Biolog GN方法 3.磷脂脂肪酸方法 4.核酸分析方法 磷脂脂肪酸法 脂肪酸是生物体基本结构成分之一，是构成细胞膜的重要物质。具有结构多样性和高的生物学特异性，是特别有效的生物标记物。 脂肪酸甲酯（Fatty Acid Methyl Ester, FAME）谱图分析方法是鉴于脂肪酸可作为生物标记物而发展起来的分析技术。 FAME谱图分析的脂肪酸多为磷脂脂肪酸，所以该方法又称为PLFA谱图分析方法。 FAME谱图分析方法是在细胞组分水平上研究微生物的重要技术，通过分析微生物细胞膜上磷脂脂肪酸（Phospholipid Fatty Acid, PLFA）的组分来鉴定微生物的种属、分析微生物多样性，是一种简便、可靠的分析方法。 PLFA谱用于研究复杂群落中微生物的多样性。 PLFA谱适合总微生物群落分析，可以表征不可培养微生物。 FAME图谱的工作流程 三、植物内生菌的研究进展 内生菌：内生菌是其生活史的某一个阶段或整个阶段生活与健康植物各种组织和器官内部或细胞间隙并且正常情况下不引起病害的微生物，包括细菌，放线菌和真菌。 内生菌有寄主特异性，与寄主植物是互利共生的关系。 植物是一个复杂的微生态系统，在植物微生态系统中内存在大量的内生菌，不同的微生物占据不同的生态位，微生物间能够相互作用，并建立一种生态平衡。 内生菌的种群结构反映了特定的植物品种特性，生理状态，营养状态，气候状态，是活的植物状态标记 。 水稻内生微生物是水稻生长过程物质分析系统的基本组成部分，在生物物质循环中有极其重要的作用。 丰富多样的微生物种类不仅是维持水稻健康的重要因素，多样性的变化也是监测水稻特性变化的敏感指标，因此水稻内生微生物多样性一直是微生物生态学研究的重要内容。 因此，我们可以通过内生菌在水稻植株内的这种动态变化，并通过脂肪酸分析来标记水稻品种，为水稻品种标记开辟新的思路和方法。 研究内容 具体方法： 1、植株及根际土内生菌的分离，纯化，保存。 2、内生菌的鉴定 脂肪酸鉴定 分子鉴定 3、水稻植株及根际土总脂肪酸检测 项目特色 1、本项目试用42个水稻品种，水稻品种丰富，研究尺度大，研究结果可靠性高。 2、菌株鉴定采用脂肪酸鉴定和分子鉴定相结合，提高了结果的可靠性。 3、通过水稻植株和根际土脂肪酸生物标记，来研究水稻体内和根系中微生物的群落结构和生物多样性，为水稻品种的标记开辟了新思路和新方法。 预期目标 通过本研究，找出不同品种水稻体内内生菌的定殖规律。 通过磷脂脂肪酸法，找出不同品种水稻的微生物标记。 * * 样品 脂肪酸提取 脂肪酸纯化 PLFA FAME GC分析 FAME图谱 其他类脂化合物 水稻植株不同部位微生物多样性研究 不同品种水稻内生菌多样性的研究 不同生育期水稻内生菌多样性的研究 不同地区水稻内生菌多样性的研究 不同季节水稻内生菌多样性的研究 不同土壤水稻内生菌多样性的研究 不同施肥水平水稻内生菌多样性的研究 水稻体内和根系土中微生物结构相关性。 水稻内生菌多样性的空间分布 水稻内生菌多样性的时间分布 不同水稻品种采集 植株 根际土 内生菌分离、纯化、保存 脂肪酸鉴定 分子鉴定 总脂肪酸的检测 水稻品种脂肪酸生物标记 技术路线 *