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基因晶片 實驗設計 探討(3) 華聯快訊一連三期 (7~9月 ) 為大家介紹基因晶 D 模組之實驗設計 片的實驗設計種類。先為大家複習一下： A_模組 D 分析模組為有時間差或刺激因子劑量差別的 (7月 ) 為成對樣品的實驗設計；B 、C 模組 (8 月 ) 實驗設計。以下以 C 套餐的感染後給藥作為說明 為多樣品實驗設計，前者可找出樣品間的共同或 範例。在 C 套餐的說明中我們將實驗設計的變因 相異之處，後者可用來探討樣品間的關連性。本 僅限制在單純的交互作用，但其實此類實驗尚可 期再繼續介紹 D 及 E 模組實驗設計，分別為單因 包含時間變因，如動物養殖 /細胞培養時間、投藥 子影響及多因子交互作用。 時間點、投藥過程及投藥後等待反應的時間等； 或刺激因子或藥物劑量變因，如 LPS 投入劑量、 模組 圖示 說明 藥物劑量的多寡等。以投藥過程為例，此變因可 Tumor to A1 Pairwise adjacent 再細分為治療周期與治療持續時間。常見之治療 Normal 週期為 5 天或 7 天為一個週期單位，而治療持續 Control to A2 Non Pairwise Treat 時間可長達 1 個月至半年。有時也不須有治療周 B Multi 尋找共同或 期與治療持續時間，可視研究者需要僅投藥一次 independent 差異 或數次。而無論是以上哪一種實驗，基本上都必 感染後給藥 C Cross Knockout and 須注意生物性重複與技術性重複的問題，例如在 interaction Knockout treat 以 LPS 感染老鼠實驗中，因不可能有兩隻老鼠的 Time Series 隨時間變化 基因表現會完全相同，有些老鼠可能在施藥後會 D Analysis Dose response 馬上死亡，但有些老鼠卻有很強的耐受性，或是 2 factors 多種變因 操作人員量測 LPS 的劑量有些微不一，因此必須 E Time × Dose 交互作用 使用多隻老鼠來降低個體性差異。 1 2012.09 E 模組之實驗設計 D 與 E 模組之基因晶片結果 E 分析模組為有兩種變因因