基因的遗传多样性分析.PDFVIP

维普资讯 南京农业大学学报 2007，30 (4)：108～113 JournalofNanjingAgriculturalUniversity 貂、狐、貉源犬瘟热病毒分离株 日和 Ⅳ 基因的遗传多样性分析 王君玮 ，姜平 ，王志亮 ，张维 ，李林 ，赵永刚 (1．南京农业大学动物医学院，江苏 南京 210095；2．中国动物卫生与流行病学中心，山东 青岛 266114) 摘要：为研究鼬科动物犬瘟热病毒 (CDV)毒株的变异特性，对来 自不同地区的貉、狐、貂的5个 CDV分离株 (其中 HD—m、LN—m为貂源，HTp_r’THD1一r为貉源，HB—f为狐源)和 1个CDV国内弱毒疫苗株 (vCh)的Ⅳ基因和部分H基 因进行了核苷酸测序，并构建系统发生树。结果表明，5个分离株之间H基因核苷酸序列同源性均达到97．5％以上，而 Ⅳ基因为94．5％一99．8％。vCh与5个分离株的H基因和Ⅳ基因核苷酸序列同源性普遍较低 (H基因：90．5％～91．8％； Ⅳ基因：90．9％ ～93．5％)，而与国外疫苗株vCon和yOnder的H基因核苷酸同源性达96．8％和97．2％。分离株之间H 蛋 白氨基酸同源性差别不大 (97．1％ ～100％)，而N蛋 白氨基酸同源性差别较大 (91．6％ ～100％)。5个 CDV分离株 与vCh疫苗株H蛋白和 N蛋白同源性均普遍较低 ，H蛋 白为89．7％ ～91．8％，N蛋 白为 92．8％ ～96．8％。vCh与 yOnder、vCon有很高的同源性，其H蛋白氨基酸同源性分别为97．1％和95．6％，vCh与 yOnderN蛋白氨基酸同源性达 97．3％。结果显示 ，最近犬瘟热的流行和免疫失败现象的发生与国内所用疫苗毒株和野毒株的遗传关系甚远有关。 关键词：犬瘟热病毒；H基因；N基因；同源性 ；遗传分析 中图分类号：$858．292；s858．92 文献标识码：A 文章编号：1000—2030 (2007)04—0108—06 PhylogeneticcharacterizationofH geneandN geneofcaninedistemper virusdetectedin naturallyinfectedraccoon dogs，foxesandminks WANGJunwei。，JIANG Pingh ，WANGZhi．1iang ，ZHANGWei，LILin ，ZHAO Yong．gang (1．CollegeofVeterinaryMedicine，NanjingAgricuhuralUniversity，Nanjing210095，China； 2．ChinaAnimalHealthandEpizoologyCentre，Qingdao266114，China) Abstract：Tocharacterizethevariabilityofrecentfieldisolatesof5caninedistempervirus(CDV)strainsfromdifferenthostsand geographical raeas．nucleotidesequenceanalysisofthe圩 genenadtheN geneencodingthehaemagglutininandthenucleocapsid proteinwereconducted，respectively．Pronounceddifferencesbetween5fieldisolateswererevealedincomparisontotheattenuated vaccinestrainsvCh，vConandyOnder．PhylogenetictreeswereconsturctedwithH／N geneof5CDV isolates，vaccinestrainvCh nad12／11CDVstrainsinGenBnak．Results：Thehomologyofnucleicacidsequencesamongthe5isolateswashigh(H gene： 97．6％一99．9％ andNgene：9