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蛋白质的生物合成-umethods
蛋白质的生物合成,即翻译,以mRNA为模板形成蛋白质的过程,就是将核酸中由 4 种核苷酸序列编码的遗传信息,通过遗传密码破译的方式解读为蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序 。 20世纪生物化学史上的三大进步 Zamecnik证明了蛋白质合成的场所是核糖体 发现氨基酸被激活后,与tRNA结合 Crick推测tRNA的功能是适配器,导致遗传密码的阐明 参与蛋白质生物合成的物质包括 20种氨基酸(AA)作为原料 酶及众多蛋白因子,如IF、eIF ATP、GTP、无机离子 蛋白质合成的场所(工厂)是核糖体; 运输氨基酸到模板上的是tRNA—适配器; 模板是mRNA; 氨基酸变为活化态与tRNA共价结合形成氨酰tRNA,催化这个过程的酶叫氨酰tRNA合成酶。 一、mRNA ---模板 m RNA是蛋白质生物合成过程中直接指令氨基酸掺入的模板,是遗传信息的载体。 原核生物和真核生物mRNA的比较 原核细胞mRNA的结构特点 真核细胞mRNA的结构特点 二、氨基酸转运工具--tRNA * tRNA的一级结构特点 含 10~20% 稀有碱基,如 DHU 3′末端为 — CCA-OH 5′末端大多数为G 具有 T?C 密码子与反密码子的配对关系 在蛋白质合成中处于关键地位,它不但为每个三联体密码子译成氨基酸提供接合体,还为准确无误地将所需氨基酸运送到核糖体上提供运送载体。 核糖体的组成 四、氨酰-tRNA合成酶 氨酰- tRNA合成酶的特点 氨基酸的活化 1.氨酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。 2.氨酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreading activity) 。 3.氨酰-tRNA的表示方法: Ala-tRNAAla Ser-tRNASer Met-tRNAMet 生物体内有两种tRNA用于运转蛋氨酸:起始密码子——AUG; 用于中间参入的密码子AUG分别标记为: Met-tRNAMet 和fMet-tRNAfMet只有一种蛋氨酸的氨酰tRNA合成酶 起始肽链合成的氨酰-tRNA 五、 什么是遗传密码和密码子? 遗传密码: DNA(或mRNA)中的核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的对应关系称为遗传密码。 密码子(codon):mRNA上每3个相邻的核苷酸编码蛋白质多肽链中的一个氨基酸,这三个核苷酸就称为一个密码子或三联体密码。 (1)、三联体密码的破译 以均聚物为模板指导多肽的合成 以特定的共聚物为模板指导多肽的合成 (2)几个基本概念 错义蛋白:在阅读一个mRNA分子,开始时阅读框就必须正确无误,如果在阅读框开始时错过一个或两个碱基,或在mRNA上的核糖体偶然跳过了一个核苷酸,随后的所有密码子将会与原来不同,从而导致错义蛋白。 起始密码子(initiation codon):AUG,多肽链开始的 信号。 终止密码子(termination codon):也称无意义密码子, 多肽链终止的信号,UAA、UAG、UGA。 Trp和Met是唯一密码子编码的。 1. 连续性 2. 简并性(degeneracy) 3. 通用性 蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。 已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。 密码子的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。 4. 摆动性 密码子、反密码子配对的摆动现象Crick 提出的摆动学说 从mRNA 5?端起始密码子AUG到3?端终止密码子之间的核苷酸序列,连续50个以上密码子排列编码,无终止密码子,这段顺序称为开放阅读框架(open reading frame, ORF)。 翻译的起始(initiation) 翻译的延长(elongation) 翻译的终止(termination ) 一、原核生物的翻译过程 (一) 起始阶段 1.核蛋白体大小亚基分离----IF3; 2.mRNA与小亚基结合; 3.起始氨基酰-tRNA与小亚基结合; 4.核蛋白体大亚基结合; 蛋白质合成起始需要的因子 30S小亚基 mRNA 起始fMet-tRNAfMet 起始因子---IF1、IF2、IF3 GTP 50S大亚基 肽链合成的起始 70S起始复合物的组分 起始因子的功能 IF1----占据A位,防止结合其他的氨酰tRNA; IF2----促进起始氨酰tRNA与小亚基的结合; IF3----促进大小亚基的结合,提高P位的敏感性。 (二) 延长阶段 肽链延长在核蛋白体上连续性循环式进行,又称为核蛋白体循环,每次循环增加一个氨基酸,包括以下三步:
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