基因芯片设计及数据分析软件系统-东南大学学报.PDF

第３０卷第５期 东南大学学报（自然科学版） Ｖｏｌ３０Ｎｏ５ 　 ２０００年９月 ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＳＯＵＴＨＥＡＳＴＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ） 　 Ｓｅｐｔ．２０００ 　　　　　　 基因芯片设计及数据分析软件系统 孙　啸　 王　晔　 张晓莉　 谢建明　 陆祖宏 （东南大学分子与生物分子电子学实验室，南京２１００９６） 摘　要　基因芯片是提取生物分子信息的一种新技术，该技术是分子生物学与电子 信息科学交叉的产物．基因芯片在基因型分析、基因表达监控和疾病检测方面有着重 要的应用．本论文分析基因芯片中的信息处理问题，介绍一个高密度基因芯片设计及 数据分析软件系统，该系统包括基因芯片探针设计、芯片优化、杂交图像处理和检测 结果分析等功能． 关键词　基因芯片；ＤＮＡ阵列；探针设计；优化；数据分析 分类号　Ｑ５２ 基因芯片（ｇｅｎｅｃｈｉｐ），又称ＤＮＡ微阵列（ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ），是由大量ＤＮＡ或寡核苷酸探针密 集排列所形成的