大学分子生物学期末考试笔记.docVIP

分子生物学 、生物大分子及其相互作用 1.构型：因分子中存在不对称中心而产生的异构体中的原子或取代基的空间排列关系。改变涉及共价键的断裂并重新建立。 2.构像：分子共价键结构不改变仅共价单键的旋转所产生的原子的空间排列。 3.一级结构：共价键主链上氨基酸或核苷酸的排列顺序（肽键、磷酸二酯键） 二级结构：多肽链自身原子的局部空间排布（ɑ螺旋、β折叠、β转角、无规则卷曲） 三级结构：所有原子的空间排布。四级结构：球状分子蛋白 蛋白质维系力：一级：肽键、二硫键。二级：氢键。三级：疏水作用力,氢键、范德华力,盐键（离子键）四级：疏水作用力,氢键、盐键、配位键。 、核酸 DNA的一级结构指4种dNTP （dAMP、dCMP、dGMP、dTMP）按照一定的排列顺序，以3’、5’磷酸二酯键相连而成的多聚脱氧核糖核苷酸。 DNA 的二级结构：指两条反向平行多核苷酸链盘绕所产生的双螺旋结构。 （1）两条反向平行多核苷酸链盘绕所产生的双螺旋结构，两条链围绕成一个中心轴形成右手螺旋，双螺旋的直径为2nm （2）有脱氧核糖与磷酸间隔相连形成的亲水骨架位于双螺旋的外侧，疏水的嘌呤与嘧啶碱基对位于双螺旋的内部。碱基平面与中心轴垂直，糖环平面与中心轴平行，多核苷酸琏的走向为3′→5′为正方向 （3）螺旋圈旋转一周约为10个碱基对，螺距为3.4nm,相邻碱基平面的间隔为0.34nm，并有一个36度的夹角。 （4）两条链依靠碱基之间的氢键结合在一起，A与T形成2个氢键，C与G形成三个氢键。 （5）双螺旋结构中，两条核苷酸琏配对偏向一侧，形成一条大沟和一条小沟。 （6）当一条多核苷酸链的序列确定后，根据碱基互补配对原则，另一条互补链的序列也被确定。 维持稳定作用力：氢键、碱基堆积力、正负电荷的作用、碱基分子的内能 三级结构：在二级结构的基础上，通过扭曲和折叠所形成的特定构象。 染色质：以双链DNA作为骨架与组蛋白和非组蛋白以及少量的各种RNA等共同组成的丝状结构的大分子物质。 tRNA：三叶草二级结构，4环4茎， 4环：DHU环、TΨC环、额外环、反密码子环 4茎：DHU茎、TΨC茎、氨基酸接受茎、反密码子茎 6.变性：DNA双链的氢键断裂，双链变成单链，从而使核酸的天然构象和性质发生改变的过程。 7.增色效应：变性后的DNA，由双链变为单链，原来隐藏在双螺旋内部的发色基团暴露出来，在260nm紫外吸收值增高。 8.溶解（解链）温度：一半的DNA双螺旋解为单链所对应的温度 9.复性：变性的DNA在适当的条件下，可使两条分开的链重新结合，恢复双螺旋结构 10.核酸的分子杂交：含有互补序列的核酸，通过变性复性处理，DNA-DNA同源序列间及DNA-RNA异源序列形成杂交体。 第三章、DNA的生物合成 1.半保留复制：子代DNA分子中一条链来自亲代，另一条链是新合成的 2.半不连续复制：DNA一条链的合成方向和复制叉的前进方向相反，不能连续复制，只能分成几个片段合成。 3.复制方式：复制叉式、滚环式（双链环状）、D噜噗（线粒体）。 4.复制所需酶类：（1）DNA聚合酶（2）合成RNA引物酶（3）DNA连接酶（4）DNA解链酶（5）单链结合蛋（SSB）（6）拓扑异构酶 5.原核生物DNA复制的过程： 5.1起始：（1）DNA解旋、解链、形成复制叉。需要解旋酶、解链酶、单链结合蛋白（2）RNA引物合成。需要合成RNA引物酶。 5.2延伸：DNA聚合酶Ⅲ在引物上加入脱氧核糖核苷酸，前导链的合成与复制叉移动同步，持续合成；滞后链分段进行。需要β夹子、γ复合物（β夹子装卸器） 5.3终止：复制叉在终止区相遇并停止，复制体解体，除去RNA引物通过修复方式填补空缺，连接酶连接冈崎片段，形成双链子代DNA DNA复制特征： 6.1半保留复制6.2半不连续复制，有前导链和后滞链之分6.3复制起点具有特殊的序列6.4需要RNA作为引物，以后引物被切除，补上DNA6.5DNA合成方向是5’→3’6.6存在多种复制方式，但以复制叉式为主6.7复制的高度忠实性 7.复制的高度忠实性 7.1DNA聚合酶的高度专一性（严格遵循碱基配对原则）7.2DNA聚合酶的校对功能（错配碱基被3-5外切酶切除）7.3始时以RNA作为引物7.4DNA聚合酶催化的反应机制（仅从5′→3′方向合成）7.5错配校正系统（消除因核酸外切酶校正缺陷而产生的复制错误） 真核、原核生物的复制特点 相同1.半保留、不连续复制2.都有引发、延长、终止三个阶段3.都必须有相应功能的蛋白质和酶参与。区别：1真核复制速度比原核慢2.真核在全部复制起点完成前，各个复制起点不再开始复制；原核的复制起点可以连续复制，一个复制起点，多个复制叉。3.真核有多种聚合酶，两种复制因子RFA(真核单链结合蛋白质