金黄色葡萄球菌疫苗候选分子SirH的B细胞抗原表位预测.pdfVIP

成都医学 院学报 2012年第 7卷第 4期 JournalofChengduMedicalCollege，20l2，Vo1．7，No．4 网络出版地址 ：http：／／www．cnki．net／kcms／detail／51．1705．R1430．002．html doi：10．3969／j．issn．1674—2257．2012．04．014 · 论 著 · 金黄色葡萄球菌疫苗候选分子 SirH的 B细胞抗原表位预测 刘丽娜 ，潘渠 ，谭承建” (1．贵阳医学 院医学生物技术教研室 ，贵阳 550004；2．成都医学院病原生物学教研室，成都 610083 3．贵州 民族大学化学与环境科学学 院，贵 阳 550025) 【摘要】 预测金葡菌疫苗候选分子 SirH 的B细胞抗原表位 。用 PCR方法从金葡菌临床分离株 的基 因组 DNA中扩增 sirH基 ，插入表达载体 pET一28a(+)中，构建重组表达载体 pET28a—sirH，双酶切鉴定并测序 ，通 过与 GenBank中登录的金葡菌 sirH基因序列的比对 ，获得此l临床分离株 sirH 的核苷酸序列和推导的氨基酸序 列 。在此基础上 ，应用生物信 息学软件分析 SirH蛋 白的二级结构柔性 区域 、亲水性 、表面可能性和抗原指数等参 数 。综合各参数预测结果 ，SirH 蛋 白 N端第 4957、6275、83123、128162、194—208、242252、334—350、401-415、 452543、550—564、573—622区段很有可能存在 B细胞抗原表位 。SirH蛋 白B细胞抗原表位 的预测 ，为后续表达 SirH主要抗原表位和研究其免疫保护作用奠定了基础 。 【关键词】 金黄色葡萄球菌 ；SirH；B细胞抗原表位 ；预测 【中图分类号】 R392 【文献标 志码】 A PredictionofB cellantigenicepitopeforvaccinecandidateSirH againstStaphylococcusaureus LIU LiHa ，PAN Q “，TAN Chengjian (1．Departmento／、Med’alBiotechnology，GuiyangMedicalUniversity，Guiyang 550004，China；2．DepartmentoyPathogenicBiology，ChengduMedi~alCollege，Chengdu610083，China；3．S(’hool OyChemistryandEnvironmentalScience，GuizhouMinzuUniversity，Guiyang550025，China) [Abstract] BcellantigenicepitopeforvaccinecandidateSirH againstStaphylococcusaureuswaspredicted． ThesirH genewasamplifiedfrom genomicDNA ofStaphylococcusaureusclinicalstrainbyPCR．Thegenefragment wasinsertedintotheexpressionvectorpET 28a(+ )tobuildpET28asirH．Therecombinantplasmidwasidentified byrestrictionanalysisandsequencing．ThenucleotideanddeducedaminoacidsequencesofsirH genewerecompared withthoseofStaphylococcusaureusavailab