第二RNA组学.pptVIP

RNA组与RNA组学 第一节 RNA的结构与功能 第二节 RNA的生物合成 第三节 真核生物RNA的转录后加工 RNA的种类及主要功能 Ribosomal RNAs (rRNAs): translation Transfer RNAs (tRNAs): translation Messenger RNAs (mRNAs): protein template Intracellular small RNA( insRNAs): various types and functions 一、mRNA的结构和功能 真核生物DNA转录生成的原始转录产物是核不均一RNA(hnRNA， RNA前体)，经过5加帽和3酶切加多聚腺苷酸，再经过RNA的剪接，编码蛋白质的外显子部分就连接成为一个连续的可读框(open reading frame，ORF)，通过核孔进细胞质，作为蛋白质合成的模板。 （一）加帽 真核生物的mRNA(不包括叶绿体和线粒体)5 端都是经过修饰的，基因转录一般从A起始，第一个核苷酸保留了5 端的三磷酸基团，转录产物的起始序列为pppApNpNp…… 加帽过程是指mRNA前体5 ′端第一个核苷酸前方，以5 ′ → 5 ′ 连接方式加上一个三磷酸鸟苷酸。然后在甲基转移酶的作用下进行甲基化。 （二）加尾 除组蛋白基因外，真核生物mRNA的3′末端都有poly(A)序列，其长度因mRNA种类不同而变化，一般为40～200个A 。 大部分真核mRNA有poly(A)尾巴，细胞中还有1/3没有poly(A)mRNA（组蛋白基因） 带有poly(A)的mRNA称为poly(A)+， 没有poly(A)的mRNA称为poly(A)－。 二、tRNA的结构与功能 tRNA中含丰富的稀有碱基（约70余种碱基和核糖残基） 识别密码子 特异性搬运氨基酸 三、rRNA的结构与功能 rRNA是细胞内相对分子质量最大，代谢最稳定，含量最多的一类RNA。 5.8S rRNA 真核生物大亚基特有的rRNA，具有160个核苷酸 与原核生物 5S rRNA功能相似、与tRNA相互识别 18S rRNA 对应于大肠杆菌16S rRNA有广泛的同源性。位于小亚基中。 28S rRNA rRNA之间以及rRNA与tRNA及mRNA之间存在有机的联系，这种关系是建立在序列互补或同源的基础之上的。 四、其他小分子RNA 1、核内小RNA 2、核仁小RNA 3、催化性小RNA 4、小干扰RNA 5、微小RNA 第二节 RNA的生物合成 转录(transcription): 是指以DNA为模板，在依赖于DNA的RNA聚合酶催化下，以4种NTP（ATP、CTP、GTP和UTP）为原料，合成RNA的过程。 转录的基本过程 模板识别: 转录起始： 通过启动子： 转录延伸： 1、原核生物转录的过程 1.1、转录酶 1.2、转录启动 1.3、转录延伸 1.4、转录终止 1.1.3、各亚基的功能 α因子 σ 因子 ? σ因子可重复使用 ? 修饰RNApol构型 ? 使全酶能识别启动子的 (－35区), 并通过σ与模板链结合 ? 不同的σ因子识别不同的启动子 E.coli 中有四种σ因子（σ70、σ32、σ54、σ28） 枯草杆菌中有11种σ因子 （σ因子的更替对转录起始的调控） 1.2、启动子 A 原核生物启动子的特点 (1)结构典型,都含识别（R),结合（B)和起始 （I）位点; (2)序列保守; (3)位置和距离都比较恒定； 原核生物启动子的特点 (1)直接和多聚酶相结合； (2)常和操纵子相邻； (3)位于基因的5端； (4)决定转录的启动和方向。 全酶紧密地结合在-10序列处，模板DNA局部变性，形成开放的启动子二元复合体 4. 酶移动到第一个NTP转录开始,形成酶-启动子-rNTP三元复合体 RNA链延伸过程 ?亚基脱落，RNA–pol聚合酶核心酶变构，与模板结合松弛，沿着DNA模板前移； 在核心酶作用下，NTP不断聚合，RNA链不断延长。 蠕虫转录模型 RNA链延伸的暂停 链延伸速度不恒定，在DNA的某些区域，转录速度减慢或停止(降低叫Pause)，常发生在富含GC区。 RNA链延伸的再次启动 被停止的RNA聚合酶可再