第二章 序列收集与存储(ok).pptVIP

生物信息学 序列与基因组分析; 目录;§1 分子生物信息数据库;根据生命科学不同研究领域的实际需要，对基因组图谱、核酸和蛋白质序列、蛋白质结构以及文献等数据进行分析、整理、归纳、注释，构建具有特殊生物学意义和专门用途的二次数据库。 一般说来，一次数据库的数据量大，更新速度快，用户面广，通常需要高性能的计算机服务器、大容量的磁盘空间和专门的数据库管理系统支撑；二次数据库的容量则小得多，更新速度也不像一次数据库那样快，也可以不用大型商业数据库软件支持，这类针对不同问题开发的二次数据库的最大特点是使用方便，特别适用于计算机使用经验不太丰富的生物学家。 序列数据库是分子生物信息数据库中最基本的数据库，包括核酸和蛋白质两类，以核苷酸碱基顺序或氨基酸残基顺序为基本内容，并附有注释信息。;染色体;§2 DNA测序;A;Fig 2.3 通过寡核苷酸引物对DNA分子进行连续测序. DNA单链通过与已知序列互补的寡核苷酸引物(蓝色)进行引导测序。根据测得的序列，可以在下游产生两种引物，一种(绿色)可以对同一条单链继续测序，另一种引物(紫色)通过和互补链进行杂交，对互补链进行反方向的测序。这也提供了所得序列进行确认以提高精确度的一种途径。;§3 基因组测序;Map fragments;§4 cDNA文库测序;Fig 2.5 单链cDNA分子合成示意图;基因调控研究表明，人体每一个细胞、