植物活性长末端重复序列反转录转座子研究进展.PDF

生 物 工 程 学 报 梁琳琳 等/植物活性长末端重复序列反转录转座子研究进展 409 Chinese Journal of Biotechnology /cjbcn April 25, 2016, 32(4): 409−429 DOI: 10.13345/j.cjb.150279 ©2016 Chin J Biotech, All rights reserved 综 述 梁琳琳，周明兵 311300 , . . , 2016, 32(4): 409–429. Liang LL, Zhou MB. Plant active LTR retrotransposons: a review. Chin J Biotech, 2016, 32(4): 409–429. 摘 要: 长末端重复序列 (Long terminal repeat ，LTR) 反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类可移 动的 DNA 序列，它们以 RNA 为媒介，通过“复制粘贴”机制在基因组中不断自我复制。在高等植物中，许 多活性的LTR 反转录转座子已被详尽研究并应用于分子标记技术、基因标签、插入型突变及基因功能等分析。 本文对植物活性 LTR 反转录转座子进行全面的调查，并对其结构、拷贝数和分布以及转座特性进行系统的归 纳，分析了植物活性LTR 反转录转座子的gag (种属特异抗原) 和pol ( 聚合酶) 序列特征，以及LTR 序列中顺 式调控元件的分布。研究发现自主有活性的LTR 反转录转座子必须具备 LTR 区域以及编码Gag 、Pr 、Int 、Rt 和Rh 蛋白的基因区。其中两端LTR 区域具有高度同源性且富含顺式调控元件；Rt 蛋白必备RVT 结构域；Rh 蛋白必备 RNase_H1_RT 结构域。这些结果为后续植物活性 LTR 反转录转座子的鉴定和功能分析奠定了重要 基础。 : 长末端重复序列反转录转座子，转座，LTR ，gag ，pol Plant active LTR retrotransposons: a review Linlin Liang, and Mingbing Zhou The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Sil-viculture, Zhejiang A F University, Lin ’an 311300, Zhejiang, China Abstract: Long terminal repeat (LTR) retrotransposons are mobile DNA sequences that ubiquitously exist in eukaryotic genomes. They replicate themselves in the genome by copy-paste mechanism with RNA as medium. In higher plants, many Received: June17, 2015; Accepted: August 19, 2015 Supported by: Natural Science Foundation of Zhejiang (No. LR12C16001), National Natural Science Foundation of China (Nos. . Corresponding author: Mingbing Zhou. Tel: +86-571 E-mail: zmbin@163.com (No. LR12C16001) (Nos. 2015-09-17