发育系统树与遗传距离算法.docVIP

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2017-08-24 发布于河南
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发育系统树与遗传距离算法.doc

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发育系统树与遗传距离算法

如何建系统发育树和计算遗传距离：先在NCBI上找到要比较的序列，并且把序列复制到写字板中，格式如下所示：打开Clustal X2软件，界面如下点击File选择Load Sequences，选择刚才编辑好的写字板，注意写字板必须存放在英文字母的文件夹中。 3、点击Alignment中的第一项，进行各序列比对，比对结束之后，点击Output Format Option选择保存格式，点击确定。最后的格式会保存写字板所在的地方。 Aln格式转换成mega格式：打开已经保存好的这个软件，点击上面黄色标志的第二个标志，出现如下界面：接着点击Utilities，在其下拉菜单中点击第一个选项，出现对话框，点击OK，出现对话框，把mega格式保存起来。遗传距离和系统发育树的建立：打开MEGA软件，点击Fild打开mega格式数据，分离点击Plylogeny和Distence建树和计算其遗传距离。