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DNA生物传感器应用及展望

DNA生物传感器应用及展望摘要:DNA生物传感器是一种由特异性序列探针和信号转换器相结合而制成的分析装置,在基因杂交诊断中具有实时、易操作的特性,并且有很高的选择性和灵敏度。DNA生物传感器在生物、医药、环境监测和食品等领域都有较广泛的应用。文章介绍了DNA生物传感器的基本原理,详细评述其在基因检测中的应用,并提出了DNA生物传感器在编码基因分析中的发展前景。 关键词:DNA生物传感器;功能基因;应用;展望 中图分类号:TP212.3 文献标识码:A 文章编号:1000-8136(2012)11-0003-02 1引言 DNA生物传感器与传统技术相比,具有快速、灵敏、操作简单、无污染,且具有分子识别、分离纯化基因等功能[1]。DNA生物传感器能测定DNA的浓度,识别部分碱基的排列顺序,确定微生物的种属,具有很强的特异性。它不仅能用于监测受感染微生物的核酸序列分析和微量污染物,而且还可用于污染物与DNA之间相互作用的研究,为解释污染物毒性作用机理提供了可能。 近年来,以功能基因多样性为核心的分子生态学研究迅速发展,综合运用生物信息学从功能基因角度研究环境微生物群落功能基因多样性分布与表达对了解微生物降解过程的本质具有重要意义。 2DNA生物传感器的原理 与其他传感器相比,DNA生物传感器在检测生物分子方面具备更高的选择性和特异性。DNA生物传感器的分子识别元件是DNA,它通过一定的杂交反应可将目的DNA的存在转变为可检测的各种信号,从而得出被分析物的浓度[2]。其设计原理是在电极上固定一条含有十几到上千条核苷酸的单链DNA,通过DNA分子杂交,对另一条含有互补碱基序列的DNA进行识别,结合成双链DNA。杂交反应在敏感元件上直接完成,换能器将杂交过程所产生的变化转变成电、光、声等信号,根据杂交前后这些物理信号的变化量,推断出被检测DNA的量[3]。是DNA生物传感器原理图。 3DNA生物传感器的应用 DNA生物传感器是发展最晚也是最快的一类新型传感器。 特别是随着人类基因组计划的发展以及流行性传染病学研究的深入,使DNA传感器在基因检测分析、污染物检测、微生物学等方面的研究起着越来越重要的作用。 3.1DNA生物传感器检测病原基因 细菌及病毒感染是引起人类疾病的主要原因之一。DNA生物传感器不仅可以用于病原基因检测、基因疾病诊断、DNA损伤的研究,还能分析一些药物与DNA的作用机理,进行特定药物的设计合成,从而应用于临床诊断、体外药物的筛选。 Niu[5]等将单链HIV病毒基因共价固定在修饰后的玻碳电极上,以[Co(phen)2IP]2+为杂交指示剂,成功地检测到了HIV病毒基因。该传感器的灵敏度和选择性较高,检出限达到27 pmol,线性范围为1.6×10-10~6.2×10-9 M。Lin[6]等将共价结合的DNA探针固定在玻碳电极上,与互补链杂交时引起溶液中的亚甲基蓝指示剂产生明显的电流峰值,从而对慢性骨髓性白血病病毒基因进行检测,线性范围为1.25×10-7~6.25×10-7 M,检测限为5.9×10-8 M。Li[7]等用一种电化学生物传感器对肝炎病毒B进行检测。将肝炎病毒B基因共价固定在玻碳电极上,用[Cu(dmp)(H2O)Cl2]作为指示剂,通过循环伏安法产生一定的电化学信号来表征目标检测物。该法操作简单,费用低廉且特异性和灵敏度较高。检测限为7.0×10-8 M,线性范围为8.82×10-8~8.82×10-7 M。Mikkelsen[8]等最先在电化学DNA传感器中使用Co(bpy)33+作指示剂,通过杂交指示剂的峰电流的增加,选择性地检测到囊性纤维变性基因ΔF508,检出限达到1.8 fmol。Wang等[9]用巯基取代的PNA探针固定在石英晶体振荡器(QCM)上,检测P53基因540位点G到A的突变。即使5倍过量的非互补的碱基存在时仍不干扰检测,检出限约为1 μg/mL。Almadidy[10]等采用光纤DNA生物传感器选择性地检测出大肠埃希式杆菌基因片段。通过定态荧光信号强度的变化,在20 s内即能将目标基因检测出来。Zezza[11]等用表面等离子共振DNA生物传感器对谷类作物中常见致病真菌Fusarium culmorum的基因片段进行了杂交检测,检测限为0.06pg/30ng小麦DNA,与传统的凝胶电泳法相比,该传感器显示出更高的灵敏度和特异性。 3.2DNA生物传感器检测有机污染物 有机污染物是当前环境中存在数量相当大也难以被生物降解的污染物之一,这些物质通过各种途径对人类及其他生物产 * 本文为广西财经学院校级课题资助 生较大的危害。DNA生物传感器能简便、快速、稳定的对环境中有毒、有机

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