芸薹属植物比较基因组学研究进展.pdfVIP

维普资讯 植物学通报ChineseBulletinofBotany 2007，24(2)：200—207。www．chinbullbotanyc·om · 专题介绍 · 芸薹属植物 比较基因组学研究进展 李媛媛，傅廷栋，马朝芝 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室，武汉 430070 摘要 芸薹属(Brassica)~物是双子叶植物比较基因组学研究的重点对象。经过十几年的研究，芸薹属植物比较基因组学研 究已取得很大进展。宏观共线性和微观共线性两个层次的研究均发现，芸薹属植物之间以及芸薹属和拟南芥之间都存在广泛 的共线性，表明拟南芥信息在芸薹属中具有重要应用价值。芸薹属作物基因组内存在着多个拷贝的共线性区域，支持二倍体 芸薹属作物起源于多倍体祖先的假设。 关键词 芸薹属，比较基因组，拟南芥，宏观共线性，微观共线性 李媛援，傅廷栋，马朝芝 (2007)．芸薹属植物比较基因组学研究进展．植物学通报 24，200—207． 比较基因组学(comparativegenomics)．~．称比较遗 BBCC，2n=34)3个四倍体复合种。种间人工合成的 传学，是指在不同物种之间利用共同的标记构建图谱或 研究结果表明，白菜、甘蓝和黑芥为3个基本染色体种， 对不同物种基因组相应部分(或全部)区域进行测序，比较 它们通过相互杂交和自然加倍而形成了现在的四倍体种。 它们之间的基因数 目、相对位置、结构关系等，以揭 这就是著名的禹氏三角 (U，1935)。通过对核DNA含量 示不同物种之间的基因家族成员数 目和排列顺序的异 的计算，推测二倍体芸薹属基因组约为拟南芥基因组 同。一般来讲，比较基因组学主要包括两个方面：基于 (125Mb)的3-5倍，而四倍体芸薹属基因组则是拟南芥 遗传图谱的宏观共线性和基于物理图谱或测序的微观共 基因组的 10倍左右(BennettandSmith，1976： 线性 。目前，禾本科植物的比较基因组研究最为透彻。 ArumuganathanandEarle，1991)。 而芸薹属(Brassica)植物则是双子叶植物比较基因组学 研究的重点对象。从20世纪90年代至今，经过十几年 2 芸薹属植物比较遗传图谱 的历程，芸薹属植物比较基因组学研究已在宏观共线性 和微观共线性两方面都取得了较大进展。 比较遗传作图是利用一个种的基因或者基因的部分片段 或者遗传标记，通过遗传学的方法在其它的物种中寻找 1 芸薹属植物基因组概况 其同源序列及构建相应的遗传标记图。芸薹属植物比 较遗传图谱研究可对芸薹属植物之间的结构、亲缘关 芸薹属是十字花科(Cruciferae)植物中最重要的一个属。 系及其进化演变提供分子水平的证据：特别是芸薹属和 包含许多有重要经济价值的油料、蔬菜和饲料作物。 拟南芥的比较遗传作图，将大大增加芸薹属中可供利用的 从细胞遗传学角度讲，芸薹属栽培种包括 白菜(B．rapa； 遗传标记。近年来，芸薹属植物之间以及芸薹属植物与 AA，2n=20)、甘蓝 (B．oleracea；CC，2n=18)和黑 拟南芥之间的比较遗传作图研究都取得了一些重要结果。 芥 (B．nigra；BB，2n=16)3个二倍体基本种以及甘蓝 型油菜(8．napus；AACC，2n=38)、芥菜型油菜(B． 2．1 芸誓属植物之间的比较作图 juncea；AABB，2n=36)和埃塞俄比亚芥(B．carinata； 芸薹属不同种基因组的比较研究首先是在白菜和甘蓝之 收稿 日期：2006·05-26；接受日期：2006-08-26 ’通讯作者。E-mail：yuanbeaut~@mail．hzau．edu。crt