浅析计算机技术在药物化学中的应用.docVIP

浅析计算机技术在药物化学中的应用 [摘要] 计算机在在药物化学领域研究中的重要性与日俱增,对药物化学研究工作的发展起到了推动作用，计算机技术涵盖了在药物化学方面的药物分子的设计、药物合成工艺的优化、药效物质基础研究以及药物质量分析控制等多方面的应用。 [关键词] 计算机；药物质量控制；三维模型；指纹图谱 药物化学是一门发现与发明新药、合成化学药物、阐明药物化学性质、研究药物分子与机体细胞之间相互作用规律的综合性学科，是药学领域中重要的带头学科。药物化学是一门历史悠久的经典科学，具有坚实的发展基础，积累了丰富的内容，为人类的健康作出了重要的贡献。(CAMD)着眼于分子之间相互作用的基础物理学,为制药公司提供了一种鉴别起始先导化合物的快速、可靠方法,从而大大提高了新药创新的效率。如美国的Tripos软件公司提供的分子结构与性质信息表,集成了来自数据库及通过化学分析和计算化学方法产生的数据，为分子设计所涉及的各个研究领域,提供了源泉和成功的可能。计算机图解在药物分子设计中具有重要作用，可由球和棍构成的键模型,或者是密积的实体表现。采用模拟计算方法来获取化学形态分布的信息。用模拟计算方法来获得化学形态的信息，一是要想方设法得到表征各种化学形态平衡的特征常数；二是要选择一种合适的算法。 2 计算机技术在药物研发过程中的应用 在现代中药优化设计与研发领域,信息技术能用于中药组效关系辨识、组方优化等方面。通过运用模式识别、计算机建模仿真与优化计算、多元统计分析、神经元计算等方法可对化学分析数据与生物活性数据进行相关性研究,搜索化学组分与药效相随变动规律,仿真预测药效活性,设计最优化学组分配伍等。 2.1在药物靶点的发现与确证中的应用 靶点的发现与确证是现代新药研发的第一步,也是新药创制过程中的瓶颈之一[2]。CADD的应用可以加快靶点发现的速度,提高靶点发现的准确度,从而推进新药研发。 2.2在先导化合物的发现和优化中的应用 先导化合物的发现和优化是创新药物研究成败的关键。长期以来,先导化合物的发现依赖药物化学家合成大量的化合物以及药理学家运用各种模型进行大量筛选。CADD的应用,包括基于结构的药物设计、基于配体的药物设计、高通量虚拟筛选等技术,突破了传统的先导物发现模式,极大地促进了先导化合物发现和优化。 2.3计算机辅助ADME/T研究 药物代谢动力学和毒理学是药物临床前研究的重要组成部分,其中PK反映了药物在生物体内吸收、分布、代谢、排泄的规律。在过去的新药创制过程中,约60%的药物由于ADME性质不佳或毒性过大而导致开发失败[3]。基于QSAR、 3计算机技术在药效物质基础研究 信息技术主要用于分析仪器信号处理、化学谱图数据处理与解析、药物化学信息获取与处理等方面。仪器分析信号处理是准确和全面地获取药物化学组成及结构定性定量信息的基础环节,通过对仪器信号进行滤波加工、平滑拟合、求导变换、广义积分变换、线性组合变换或数据压缩等针对性处理,可达到消除干扰、减小噪声误差、增强谱线信号、检测微弱信号、分辨重叠信号及节省存储空间等目的。化学谱图数据处理主要是运用计算数学、机器智能推理、模式识别、神经元计算及计算机搜索等手段,对药物化学量测数据进行计算解析,从而深人和全面地获取待测物质化学组份定量及结构定性等方面的分析信息揭示了药物药效物质基础。 4 计算机在中药材质量鉴别方面的应用 成都中医学院研制的“中药显微电脑识别专家系统”,该系统与显微电视录像系统配套使用,具有图像真实,操作灵活、方便、检验快速、准确的效果[5]；济南山东省新药药理研究中心根据中药玉竹及其混淆品的生药性状、组织构造及粉末特征,结合计算机技术编制了一个中药玉竹及其混淆品鉴别的系统,该系统具有鉴别、检索、修改及打印等功能,按照屏幕提示信息输入待鉴标本的特征代码或实测数值,在几秒钟内即可完成鉴别；广州广东药学院以19个细辛样品为试验集,采用化学模式识别技术对3种细辛进行鉴别,该项研究从细辛挥发油GC-MS中获得数量化分类特征,经PRIMA法处理,实现了计算机对所有样品的鉴别分类,所得结果与实际相符[6]。 5计算机在药物质量分析检测中的应用 5.1色谱分析法：色谱法是一种物理分离方法。用于中药分析，具有分离能力强、分析速度快、定量准确等特点。 5.1.1高效液相色谱法：高效液相色谱法是一种新型分离分析技术。因分离效能高，灵敏度高，分析速度快，操作自动化等特点，目前已成为药物质量研究和定量分析检测的首选方法。另外与质谱的联用使分析技术向现代化方向迈进一步，如“清开灵”注射液中胆酸类物质的定性定量分析[7]HPLC法的广泛应用，使药物有效成分含量测定及药物质量标准达到了较高的水平，为药物质量分析国际化、现代化提供了良好的技术条件。 5.1.2 薄层色谱法（TLC）和薄层扫