常微分方程系统建模.PDF

系统生物学 (Systems Biology) 马彬广 常微分方程系统建模 （第五讲） M ∂ 常微分方程 ∑ 在生物系统建模中，刻画某状态变量随时间变化的关系，用常微分方程 来描述。 对于确定性的系统而言，系统的状态变量随时间的改变，可以表达成如 下的微分方程组： dx i x f (x , , x , p , , p , t ) i 1, , n i 1 n 1 l dt 这里x 表示变量，如浓度；p 表示参数，如酶浓度或动力学常数；t表示时间。 i j dx 写成矢量形式： x f x, p , t  dt T T T 其中，x (x , , x ) , f ( f , , f ) , p ( p , , p ) 。 1 n 1 n 1 l 例如：代谢建模中，底物降解，浓度变化正比于实际的浓度，就可以表示成： c(t) k c(t) M ∂ 举例 ∑ 反应体系： c1  c2 c3 O H O H O 2 SOD 2 2 cat 2  dO  2 c c SOD O  1 2 2  dt 系统动力学方程：  dH O  2 2 c SOD O c cat H O  dt 2 2 3 2 2 可简写为：  dx  a bx dt   其中，x O , y H O , a c , b c SOD , c c cat  2 2 2 1 2 3 dy bx cy dt 