多肽合成思考-练习题.docVIP

多肽合成思考/练习题 目前多肽的常见定义？多肽的结构单元？ α－氨基酸以肽链连接在一起而形成的化合物10,000 ，并且不存在三级以上结构。 结构单元是氨基酸 多肽的类别及其分类原则， 多肽固相合成法、液相合成法的对应英文？ Fmoc Chemistry 固相合成单循环包括几个步骤？对应名称？ 大小 9肽以下 寡肽 15肽以下 小肽 15-50肽 中肽 多于50肽 大肽 结构 同聚肽: 线性肽, 环肽 杂聚肽: 色素肽,糖肽,脂肽,缩酯肽 来源 抗菌肽,激素肽,毒肽 液相合成法 Liquid phase peptide synthesis,LPPS 固相合成法 Solid phase peptide synthesis,SPPS Fmoc Chemistry 固相合成单循环 ：缩合，洗涤，去保护， 中和及洗涤， 下一轮 缩合 多肽合成中常见副产物有哪些？ 多肽偶联反应的最高追求？ 多肽裂解中常常加入俘获剂（Scavengers）。Scavengers的主要作用是啥？常见俘获剂有哪些？各自特点？ 副产物：形成天冬酰亚胺，或发生差向异构化作用 多肽合成中如何检查偶联反应的完成程度、树脂替代度和Fmoc脱除程度？ 解决困难肽序合成的常见方法？各自特点？ 请比较经Boc-、Fmoc-、Z-三种保护基保护的氨基酸的特点。 多肽固相合成中产生二酮哌嗪(diketopiperazine，DKP)是一常见副反应。请给出产生二酮哌嗪的主要原因以及减少DKP形成的常见方法。 减少DKP形成的常见方法:使用与叔丁基等效的大基团来以位阻阻止DKP的形成。 12. 请给出多肽消旋的主要原因以及目前公认的2种机理P157。 多肽合成过程中，部分氨基酸在活化的过程中会导致不同程度的消旋，特别容易消旋的氨基酸有：Cys，His，Phe，当然这些消旋化还和溶剂，温度以及合成中的有机碱等因素有关。对于这些氨基酸，可以通过采用高效缩合试剂，减少反应时间，可以减少消旋的比例 13. 给出常见的巯基保护剂P131，请给出二硫键的常见形成方法。 二硫键的常见形成方法：（ oxidative folding 将自由巯基置于包含氧化还原体系e.g.谷胱甘肽的缓冲溶液中进行桥连） 1. 空气氧化形成二硫键 肽溶解在10–3 to 10–4 M 稀醋酸溶液中或0.05 M 得醋酸铵中。调整pH在7.5 and 8 之间，室温下暴露空气搅拌。添加剂 1–10 % DMSO or 3% H2O2 可以加入来加速反应。 2.碘氧化法3. 铁氰化钾氧化法 4. 简述Z-保护基的引入方法、Z-保护氨基酸的特点？ 15. Z-保护基的脱除方法？各自特点？ 简述多肽固相合成法的优点、缺点。 优点：(1) 过量原料、辅助试剂溶于反应溶剂,接肽反应在固相载体上完成;反应完成后,过量原料、辅助试剂可被简单恰当的洗涤过程除去,操作简便; (2)可以通过试剂过量来提高反应速度和反应程度; (3)液相合成中,分子内环化反应、多位点的选择性反应通常采用高度稀释来避免副反应的发生；固相合成勿需高度稀释, 因为固相载体的反应位点基本保持在一定的距离(假稀释)。 (4) 因为简单、重复和快速的特点,固相合成容易实现自动化； (5)劳动强度较小,对生产人员的专业技能要求较低。 缺点：1)反应速度相对较慢（异相反应）； (2)载体和连接分子溶胀性的限制,固相合成不适于大规模制备； (3)树脂价昂,试剂过量很多,原料成本高； (4)合成过程中难以避免的缺损肽的存在,各种副反应所生成的消旋肽和异构肽等的出现,以及脱保护过程中因保护基的残留、肽键的断裂、烷基化等产生的杂质,分离纯化极为困难; (5)合成的肽越长,经过的循环次数越多,目标分子的收率越低,纯化越困难;等。 简述多肽液相合成法的优点、缺点。 优点：方法多样性(可以使用所有成熟的有机合成方法)； 均相反应,热分散性好,反应速度快; 大量反应可以通过控制反应釜的大小和反应物的数量而实现; 可以在每个步骤提纯、分析和鉴定产物,保证每一步原料的纯度; 不需要昂贵的树脂,投料比低(原料成本低); 缺点：(1).反应结束后,剩余原料、产物和副产物都在反应混合物中, 需要分离纯化。 (2).分离纯化常用方法 全