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综合microRNA和基因表达谱分析

综合microRNA和基因表达谱分析在肺癌新的肿瘤标记物和机制的研究摘要背景:microRNA(miRNA)在非小细胞肺癌诊断中准确性的研究仍有争议。因此,我们系统的识别非小细胞肺癌相关的miRNA,使用微阵列数据来观察目标基因改变。方法:我们从非小细胞肺癌中,筛选出五组miRNAs,从基因表达数据库里,筛选出六组基因微列阵数据。结果:我们研究表明,非小细胞肺癌中,有14对miRNA发生显著性变化。其中五对上调(miR-9,miR-708,miR-296-3p,miR-892b,miR-140-5p),9对下调(miR-584,miR-218,miR-30b,miR-522,miR-486-5p、miR-34c-3p,miR-34b,miR-516b,miR-592)。其诊断敏感性(SE)和特异性(SP)分别为82.6%和89.9%.有14对目标基因(P0.05,倍数变化2.0)和14对发现的miRNA显著相关,我们建立了一个受检者分类,使得验证有了较高的准确度(SE=0.987,SP=0.824)结论:我们研究发现,综合的miRNA和目标基因对发现和识别非小细胞肺癌的生物标记物有价值,而且为发现非小细胞肺癌的机制提供了新的视角,此外,我们精心设计了实验,对目标基因相关的14种miRNA在非小细胞肺癌的预测和预后进行了研究。前言:在世界范围内,非小细胞肺癌因其高死亡率仍然是引起癌症死亡的主要原因之一,在2014年,其死亡率占到了癌症死亡人数的1/4.近年来,在很多研究报道了非小细胞肺癌鉴别诊断的潜在标记物,然而,精确的非小细胞肺癌的生物学标记物仍需摸索。当前,microRNA (miRNA),一组小的非编码RNA的发现,为肿瘤的预测提供了新的视野,为肿瘤如非小细胞肺癌的初始筛选提供了新的方法。新的研究数据表明,miRNA在肿瘤中显著改变,和非小细胞肺癌的发生和发展有关。此外,由于miRNA的固有性质,它在标本中高度稳定,可提供更多的精准预测因素。以上发现表明,miRNA可作为非小细胞肺癌诊断的稳定的生物学标记物。然而,一些独立的研究中,对此仍有不少争议,这往往通过不同的miRNA的表达谱的系统和平台解释。虽然他们分别证实了miRNA在肿瘤分化中的价值,然而收集资料系统的分析对进一步探讨miRNA作为非小细胞肺癌预测的标记物的适用性仍然是必不可少的。所以,我们的荟萃分析回答了一下3个问题:(1)是否有miRNA可以识别或抑制非小细胞肺癌组织。(2)和目标基因功能注释的潜在miRNA和通路是否有关系,(3)这些miRNA的靶向基因是否和非小细胞肺癌的起始和进程有关。讨论:研究中,我们主要关注利用miRNA数据集,是否可以将潜在的miRNA可以作为精准的生物标记物,从而从正常组织中来区分出非小细胞肺癌,我们选择了5组微阵列数据集和陈列,来系统的识别区分非小细胞肺癌和控制的潜在的miRNA.作为一个miRNA的组合,我们发现的前14种miRNA(包括TmiR-9, miR-584, miR-708, miR-218, miR-296-3p, miR-30b, miR-522, miR-486-5p, miR- 34c-3p,miR-892b, miR-34b, miR-516b, miR-140-5p, miR-592),通过以更高的敏感性、更高的特异性和统计学上显著的路径测量,在区分对照和非小细胞肺癌案例中具有较精确的预测价值。报道中,异常表达的12种miRNA (miR-9, miR-584, miR-218, miR-296-3p, miR-486-5p, miR-34, miR-592, miR-30b, miR-708, miR-522, miR-516b, and miR-140- 5p),除了miR-516b and miR- 892b,均可作为潜在的生物标记物,在癌症病人中具有诊断价值。从一定程度上来说,异常的miR-9表达通过抑制CBX7蛋白表达 ,有助于肿瘤细胞的侵袭。在非小细胞肺癌细胞中,MiR-140-5p使MMD蛋白水平明显降低,主要通过调节Erk1/2信号,致使细胞增殖。一些miRNA如miR-584, miR-218, miR-486-5p, miR-34, miR-592, miR-30b, miR-522,其相对应的目标基因分别为CMBL/ PIP4K2A, Robol /BMI, ARHGAP5 KRAS/ PDGFR BMI1 [33], CCND3, Rab18, PHLPP1,和细胞的增殖迁移和入侵有关。值得注意的是,miR-296-3P和miR-708在不同的研究中表达不一,郭等人报道,miR-708通过抑制和死亡率增长有关的CCND1, EZH2, MMP2 Parp-1和Bcl2的表达

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