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FAT10基因遗传变异及肝细胞癌发生发展的关联性研究
摘要 ,
摘要
polymo印hism,SNP)与肝细胞癌发生和临床病理的关系。
方法:收集254例肝癌病例和268例健康对照人群外周血标本,提取DNA,
通过DNA直接测序分析方法,检测两组人群F.ATl0基因外显子和侧翼序列单核
苷酸多态性。应用Haploview统计软件分析研究对象的连锁不平衡和单体型,并
应用病例对照分析方法进行相关性研究。
结果:在病例组和对照组共检测到lO个SNPs。依据测序数据和遗传不平衡
A/G、 +3476
分析选择3个tagSNPs(.143T/C和+3527T/C)进行关联分析和单
A/G和+3476
体型构建,发现.143 T/C基因型与相应的野生型纯合子相比明显
p0.05),但这些多态性位点的基因型频率与肝癌的临床表型无关(p0.05)。另
ACT单体型频率显著低于对照组(OR=0.4
CI=1.24.2.17,
型与肝癌的发病风险仍然显著相关(pO.05)。进一步分析发现携带ATT单体型
患者的临床病理分期较晚(p0.05),而携带GCT单体型临床病理分期较早
(pO.05)。
结论:FATl0基因外显子和侧翼序列的遗传变异与肝癌的发生发展相关,
ATT单体型可能是肝癌的遗传标记。
关键词:FATlO基因;单核苷酸多态性;单体型;肝细胞癌;病例对照研究
Abstract
ABSTRACT
ex帅inedwhethernucleotide in
objectiVes:Thisstudy single polymorphism
exonicand ofthehumanHLA—F l 1
flankingsequence adjacenttranscript0(FATO)
wereassociatedwith and of
gene susceptibiIityclinicopathoIogicaldeVelopment
hapatocellularcarcinoma(HCC).
Methods:Atotalof522 268 controlsand254
suboects,includinghealthy
with wasdone DNA
HCC,were
patients recruited.Genotypingbyusing sequencing.
and wereestimated
Linkagedisequ.1ibriumanalysis
Haplotypes byhaploView
soRware.Theodds 95%con矗dence calcuIated
ratios(ORs)and intervals(CIs)were
modelto the of
unconditional estimatecorrelationsthe
using logisticregression
FATl0 Variationto of
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