柔性蛋白质折叠及结合的动力学和热力学的分析研究.pdfVIP

摘 要 自从上世纪60年代Anfin8en和他的合作者根据核糖核酸酶可逆伸展与重折 叠的研究提出蛋白质折叠过程在热力学稳定方面获得的增益是控制蛋白质在体 外正确折叠的驱动力以来，关于蛋白质折叠的动力学和热力学研究取得了很大的 进展-特别是wolynes所建立的能量形貌图理论对生物物理学的蛋白质折叠问 题提供了强有力的理论模型。从上个世纪90年代以来，人们在蛋白质折叠和结 合的动力学和热力学的研究方面取得了重要的进展，并给出了很多新的物理理解 和理论结果11。5j。 本文探索在二维和三维蛋白质折叠结合情况下影响蛋白质折叠和结合速度 的原因。研究肽链长度对蛋白质折叠和结合速度的影响。研究不同折叠结合能 量差和能量半宽对蛋白质折叠和结合速度的影响。探索不同温度下蛋白质折叠 和结合速度的变化。将不同温度下蛋白质折叠和结台速度的函数比较，发现其 规律性。井推导了三维蛋白质折叠和结合的自由能公式。 通过讨论蛋白质折叠速度随时间的演化情况，我们发现在蛋白质折叠和结合 有个特别温度，在这个温度蛋白质折叠结合的速度最快．达到天然状态的时间最 短。低于这个温度，蛋白质动能越来越小，达到天然状态的时间越来越长，这是 由于蛋白质极易陷入局域最小点。高于这个温度，蛋白质的动§＆越来越大，所以 它越来越不稳定，于是达到天然状态的时间也越来越长。这些结果在实验中都得 到了很好的验证，这就是本文的意义所在。 关键词：折叠；结合；能量形貌理论；结合折叠漏斗 Ab8t1．act hisco-workers Since√¨右nsenand fonv州theofthe brought plus stabili母of isthe driveinme basisonme mc皿ody∞micsrightf0Iding pr帆infoldingprocess ofmel_eversiblo alld study fibotide-e唧me妣沁h onthe ofkineticsand a11d haveken 3mdy tllermodynamicsf01d_mgbindiHg ofprotein t11e ofth were e啦潮isbed g≈atlypromoted．Especiallyt}I∞Iy e”端yl珏n(1sca球8荡at a mo幽1for in by只GwoIyn韶。舶redpowe响ltheory protcin fold吣andbinding have onk抽eticsand of biophysks．Peoplemade辨4tprog他ss tlle瑚odynam主cs protcin bave neW fold协gandbin曲培sillce1990s，andgivenphysicsunderstanding ∞dtll∞rcticalresul协【Ⅷ． Inmis in荫uenceonthorate p8pe‘westudy畦le