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微生物多样性分析报告 合同编号 合作单位 项目编号 分析人 报告完成时间 杭州谷禾信息技术有限公司 分析流程 基本概念 16S rRNA及其测序区域 16S rRNA OTU 我们对v3-v4双可变区域进行扩增和测 16S rRNA 基因是编码原核生物核糖体小 operational taxonomic units (OTUs) 序。首先对每个样板库的序列进行OTU 亚基的基因，长度约为1542bp，其分子 在微生物的免培养分析中经常用到，通 注释，使用QIIME（version 1.8.0）工 大小适中，突变率小，是细菌系统分类学 过提取样品的总基因组DNA，利用16S 具包进行注释，数据库使用GreenGene 研究中最常用和最有用的标志。16S rRNA或ITS的通用引物进行PCR扩增， （version gg_13_8）。 rRNA基因序列包括9个可变区和10个保守 通过测序以后就可以分析样品中的微生 项目的研究目的之一就是比较不同样本 区，保守区序列反映了物种间的亲缘关系， 物多样性，那怎么区分这些不同的序列 之间的微生物组成差异，OTU比对完成 而可变区序列则能体现物种间的差异。 呢，这个时候就需要引入operational 后进行注释，由于16S序列的高度相似 16S rRNA基因测序以细菌16S rRNA基因 taxonomic units，一般情况下，如果 性，根据V3-V4区的测序长度，只能将 测序为主,核心是研究样品中的物种分类、 序列之间，比如不同的 16S rRNA序列 序列准确的归类到属（genus）这个级 物种丰度以及系统进化。 的相似性高于97%就可以把它定义为一 别，注释结果中虽然有部分的种 个OTU，每个OTU对应于一个不同的 （species）结果，但是并不完全。 16S rRNA序列，也就是每个OTU对应 于一个不同的细菌（微生物）种。通过 OTU分析，就可以知道样品中的微生物 多样性和不同微生物的丰度。 杭州谷禾信息技术有限公司 2 OTU结果统计 OTU数目和测序统计表 SampleName SampleSize OTUsNumber OTUsSeq Coverage 150316.3.2 102383 9207 81910 0.93 150316.3.7 83901 9758 65185 0.92 050322.6.3 80874 10867 58722 0.9 050322.6.4 49343 6557 37451 0.9 1