SSR标记在苹果种质资源及遗传育种研究中的应用.pdf

2009年第 5期 SSR标记在苹果种质资源及遗传育种研究中的应用 王 娟，宋 尚伟 (河南农业大学 园艺学院，河南 郑州 450002) 摘要 ：SSR标记作为一种有效的分子标记手段 ，被广泛地应用于苹果种质资源和遗传育种研究 中。 对其在苹果种质资源保存、品种鉴定、遗传多样性、遗传连锁图谱构建、基 因标记及定位等方面的应 用做 了简要概述 。 关键词：苹果 ；简单序列重复 ；种质资源；遗传多样性 ；遗传连锁 图谱 中图分类号：$661．1 文献标识码：A 文章编号 ：1004—3268(2009)05—0016—05 SSR(simplesequencerepeat)即简单序 列重 1 种质资源保存 复，通常又称为微卫星 (microsatellite)，指以少数几 个核苷酸(多数为 2～4个 ，也有报道为 1～6个口]) 种质资源 的收集和保存是遗传育种工作 的基 为单位多次串联重 复的DNA 序列 2『]，长度一般在 础。但是，随着种质资源的不断收集，种质资源库变 2OObp以下。研究表明，微卫星在真核生物基 因组 得越来越大 ，这给保存 、评价、研究和利用种质资源 中的含量非常丰富 ，而且常常是随机分布于核 DNA 带来了众 多困难。为此 ，Frankel 提 出构建核心 中，不仅可以存在于内含子中，也可以存在于编码区 种质的设想 ，即用科学方法从整个种质资源 中选择 和染色体的其他任一 区域 。微卫星中重复单位的数 一 部分样本 ，以最小的遗传资源数量，最大限度地代 目存在高度变异 ，这些变异表现为微卫星数 目的整 表整个遗传资源的多样性。核心种质的提出可解决 丰富的遗传资源材料的保存 、评价、鉴定及利用带来 倍性变异或重复单位序列中的序列有可能不完全相 的困难，并有利于管理 、收集 、种质创新及资源的深 同，因而造成多个位点 的多态性[3．4]。在真核生物 层次研究。Mcferson 认为 ，分子标记可 以用于核 中，大约每隔 10～50kb就存在 1个微卫星，微卫星 心种质的确定 ，以便 以最少量 的种质资源最大限度 序列两侧均为保守的DNA序列，因此可 以利用和 地代表资源的遗传多样性 。HokansonI1 用 SSR 两侧 区段互补的短序列引物通过 PCR扩增重复序 结合农艺性状建立了苹果 的核心种质，并利用 8个 列本身，然后通过聚丙烯酰胺凝胶电泳 (或琼脂糖凝 SSR引物检测 了66个苹果品种 (系)，以确定遗传 胶电泳)显示 DNA重复序列 的多态性 。 同一性 、估算遗传稳定性 ，结果在 66个品种 (系)中 微卫星起初只是作为探针 ，用于真核生物基因 都发现了高水平变异 ，遗传同一性数据产生了一个 组 的 RFLP(restrictionfragmentlengthpolymor— 遗传相关性物候图，并被地理起源 以及所了解 的家 phism)研 究。随着 PCR (polymerasechain reae— 系信息所证实。 tion)技术的建立 ，SSR迅速应用于人类遗传 ]和许 多动植物